17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2568 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2568  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2871  hypothetical protein  48.72 
 
 		 285 aa  258  9e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1287  hypothetical protein  31.45 
 
 		 291 aa  118  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1756  hypothetical protein  28.87 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2859  hypothetical protein  31.89 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4915  hypothetical protein  34.51 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00458522  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5311  hypothetical protein  29.51 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10358  hypothetical protein  26.59 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.834862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0612  hypothetical protein  27.8 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1214  hypothetical protein  27.31 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0698  hypothetical protein  27.64 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0782955  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0452  hypothetical protein  27.16 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000310711  decreased coverage  0.00000000190232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  28.81 
 
 		 323 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1304  hypothetical protein  23.36 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2550  hypothetical protein  26.88 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1838  hypothetical protein  24.58 
 
 		 496 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176583  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1305  hypothetical protein  23.24 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>