15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4915 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4915  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  560  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00458522  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1287  hypothetical protein  37.39 
 
 		 291 aa  165  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5311  hypothetical protein  36.07 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10358  hypothetical protein  33.82 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.834862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1756  hypothetical protein  36.23 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2859  hypothetical protein  33.59 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0612  hypothetical protein  29.32 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2568  hypothetical protein  34.18 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2871  hypothetical protein  30.84 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1214  hypothetical protein  28.25 
 
 		 294 aa  85.5  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0698  hypothetical protein  25.25 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0782955  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0452  hypothetical protein  24.64 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000310711  decreased coverage  0.00000000190232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1305  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1304  hypothetical protein  20.3 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  22.01 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>