28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0089 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 357 aa  731    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  76.35 
 
 		 356 aa  508  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  57.26 
 
 		 683 aa  285  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  56.07 
 
 		 298 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  59 
 
 		 338 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  51.8 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  52.27 
 
 		 428 aa  219  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  52.68 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  56.41 
 
 		 767 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  50.69 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  45.31 
 
 		 494 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  49.12 
 
 		 225 aa  198  9e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  47.14 
 
 		 524 aa  195  9e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  51.28 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  52.31 
 
 		 692 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  50.52 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  50.24 
 
 		 1001 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  46.88 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  46.61 
 
 		 411 aa  189  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  50.51 
 
 		 233 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  41.41 
 
 		 1160 aa  172  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  46.4 
 
 		 212 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  44.14 
 
 		 212 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  37.74 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  32.29 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1687  polysaccharide deacetylase  45 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000644335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0701  UDP-glucose 4-epimerase  28.05 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.399918  normal  0.0107681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>