37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2346 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  30.64 
 
 
255 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  34.54 
 
 
257 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  33.2 
 
 
241 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  33.67 
 
 
255 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  42.5 
 
 
246 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2202  protein of unknown function DUF1503  33.83 
 
 
250 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  42.64 
 
 
283 aa  89.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  34.47 
 
 
266 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  30.58 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  29.62 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  31.51 
 
 
252 aa  79  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  29.51 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  29.67 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  33.87 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  29.67 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  29.67 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  29.36 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  35.26 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  29.49 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  32.84 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1408  protein of unknown function DUF1503  29.56 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  35.94 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  29.27 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  29.72 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  32.35 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  34.67 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  28.39 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  36.15 
 
 
266 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  36.54 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000041503  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  31.4 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  25.66 
 
 
249 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  26.19 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1989  protein of unknown function DUF1503  34.78 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4265  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  29.15 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  28.99 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>