129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1028 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1028  arginine repressor, ArgR  100 
 
 
150 aa  297  4e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  41.5 
 
 
152 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  38.26 
 
 
150 aa  103  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  37.84 
 
 
150 aa  102  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  37.84 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  35.81 
 
 
150 aa  90.5  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  35.57 
 
 
150 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  36.49 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  35.81 
 
 
150 aa  90.1  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  34.38 
 
 
152 aa  83.6  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  34.44 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  34.44 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  31.88 
 
 
172 aa  80.5  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  32.39 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  28.67 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  32.85 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  32.85 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  32.85 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  32.85 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  32.85 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  32.85 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  32.85 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  32.85 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  30.2 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  33.59 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  33.59 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2508  arginine repressor, ArgR  33.86 
 
 
152 aa  77  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0153884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  32.85 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  30.94 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  34.81 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  36.15 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  34.81 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  35.25 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  27.22 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  30.66 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  34.51 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  27.94 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
234 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  36.76 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  28.57 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  28.38 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  33.56 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  32.89 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  32.89 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  26.24 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  27.27 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  30.61 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0165  arginine repressor  30.41 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  29.66 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  32.89 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  32.89 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  27.21 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  25.53 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0161  arginine repressor  29.05 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1214  ArgR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  27.63 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  29.85 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  32.21 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  28.29 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  31.21 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  29.53 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  31.76 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  29.41 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  27.08 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  25 
 
 
185 aa  63.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  26.8 
 
 
159 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  31.17 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  28.99 
 
 
184 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  26.47 
 
 
171 aa  62  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  26.14 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  26.14 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  27.27 
 
 
189 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  28.17 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  28.68 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  27.7 
 
 
158 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  24.64 
 
 
180 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  28.26 
 
 
188 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  27.54 
 
 
175 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  26.76 
 
 
148 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  29.69 
 
 
200 aa  59.7  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1180  transcriptional repressor protein, putative  30.66 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000314701  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  29.93 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  26.09 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02280  arginine repressor  29.73 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  26.09 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  27.21 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0929  ArgR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  29.13 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  27.54 
 
 
184 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  23.88 
 
 
168 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  24.65 
 
 
177 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2884  ArgR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0131006  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  27.46 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0500  arginine repressor ArgR, putative  33.09 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.080727  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0446  ArgR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>