155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1180 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1180  transcriptional repressor protein, putative  100 
 
 		 148 aa  300  6.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000314701  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0500  arginine repressor ArgR, putative  42.41 
 
 		 157 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.080727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  40 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0929  ArgR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1179  ArgR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000244542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  30.19 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  37.06 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  37.06 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1600  ArgR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  36.23 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  36.23 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  36.23 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  36.23 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  34.06 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  35.51 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  34.29 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  34.29 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  34.29 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  34.29 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  34.29 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  34.29 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  32.61 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  32.61 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  34.29 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  34.29 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  33.81 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  34.29 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  32.33 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  33.33 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  31.91 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  28.48 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  32.03 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  29.86 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  28.3 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  33.57 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  29.71 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  30.37 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  30.41 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  30.5 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  32.59 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  30.5 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  29.25 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  30.72 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  29.08 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0588  arginine repressor  31.75 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  29.81 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  26.85 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597  arginine repressor  31.3 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.926684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  31.94 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  32.88 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  27.67 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  33.61 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1028  arginine repressor, ArgR  30.66 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  29.14 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  30.77 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  30.6 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  33.58 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  48.39 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  30.15 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  29.08 
 
 		 180 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  30.15 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02280  arginine repressor  48.39 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  27.63 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  29.53 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  30.94 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  28 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  28.39 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  29.66 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  30.14 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0468  arginine repressor  28.1 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000150922  normal  0.831176 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  28.86 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  29.85 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  31.91 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  28 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  28 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  26.71 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  28.39 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  28.47 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2884  ArgR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0131006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  28.37 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  31.47 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  27.66 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  29.87 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  33.57 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  26.58 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  29.32 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  26.43 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0446  ArgR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3617  arginine repressor  28.1 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.677285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3067  arginine repressor, ArgR  26.43 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3970  arginine repressor  28.1 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.17136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3762  arginine repressor  28.1 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.46105  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  29.55 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>