124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1214 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1214  ArgR family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  314  3e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0446  ArgR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
153 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  33.11 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  35.29 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  32.69 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  32.26 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  28.66 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  28.66 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  33.97 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  33.97 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  29.05 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  35.46 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  32.89 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  33.55 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  34.64 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  32 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  29.41 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  30.28 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  31.41 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  30.94 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  28.57 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  28.86 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  30.19 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  27.1 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  28.39 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  31.58 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  29.87 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  28.19 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  31.41 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  26.85 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02280  arginine repressor  29.17 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  27.74 
 
 
172 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  28.3 
 
 
178 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  28.87 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  28.87 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  27.27 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1028  arginine repressor, ArgR  29.22 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  25.9 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  29.33 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  25.97 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  28.37 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0165  arginine repressor  29.79 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  25.33 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  28.39 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  25.97 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  25.97 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  26.62 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  25.97 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  25.97 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  25.97 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  25.97 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  25.97 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  25.33 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  25.33 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  25.97 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  25.97 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  27.04 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0161  arginine repressor  30.82 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  25.32 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1179  ArgR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000244542  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  32.21 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  28.39 
 
 
185 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  25.32 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  31.08 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  26.75 
 
 
176 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0929  ArgR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1600  ArgR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  32 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  32 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  23.38 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  29.86 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2251  ArgR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  30.72 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  27.56 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2884  ArgR family transcriptional regulator  24.68 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0131006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  25.48 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  24.84 
 
 
185 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  25.85 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  25.88 
 
 
172 aa  57.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  25.85 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  28.68 
 
 
200 aa  57.8  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  26 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  26.03 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
234 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  24.03 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  27.74 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4808  arginine repressor ArgR  30 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.777034  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4864  arginine repressor ArgR  30 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4714  arginine repressor, ArgR  30 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371163  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4745  arginine repressor, ArgR  30 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4844  arginine repressor ArgR  30 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0448  ArgR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  26.8 
 
 
177 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2508  arginine repressor, ArgR  27.56 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0153884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>