53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1326 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  100 
 
 
248 aa  517  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  5.36393e-06  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  31.12 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  27.85 
 
 
237 aa  77  3e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.40979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  31.06 
 
 
243 aa  74.3  2e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  31.06 
 
 
243 aa  74.3  2e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  28.23 
 
 
240 aa  73.6  3e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  25.51 
 
 
251 aa  72  9e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.6 
 
 
254 aa  71.6  1e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.33635e-11 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  28.76 
 
 
241 aa  70.1  3e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  28.63 
 
 
270 aa  68.9  7e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  27.06 
 
 
254 aa  68.6  9e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.13034e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  26.87 
 
 
242 aa  68.6  9e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  28.11 
 
 
241 aa  67.4  2e-10  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  26.82 
 
 
255 aa  67.4  2e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.31 
 
 
262 aa  66.6  3e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  28.44 
 
 
264 aa  62.8  5e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  28.44 
 
 
264 aa  62.8  5e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  26.7 
 
 
272 aa  61.2  1e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  28.9 
 
 
250 aa  61.6  1e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  27.31 
 
 
264 aa  61.2  1e-08  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.05616e-08 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  23.98 
 
 
243 aa  62  1e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  24.28 
 
 
262 aa  61.2  2e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  27.32 
 
 
227 aa  57  3e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.85682e-15 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  26.78 
 
 
241 aa  56.6  4e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  26.05 
 
 
250 aa  56.6  4e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  28.77 
 
 
243 aa  56.2  5e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.83202e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  28.77 
 
 
243 aa  56.2  5e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.07553e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  27.75 
 
 
246 aa  56.2  5e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.05 
 
 
243 aa  55.5  7e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  25 
 
 
235 aa  52.8  5e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  25.22 
 
 
245 aa  52.8  6e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  4.19892e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  27.27 
 
 
218 aa  51.6  1e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  5.59589e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  24.27 
 
 
744 aa  50.8  2e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  24.65 
 
 
238 aa  50.4  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  26.44 
 
 
243 aa  51.2  2e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  25 
 
 
248 aa  49.3  5e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  3.23164e-05 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  24.31 
 
 
235 aa  48.9  8e-05  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  25.37 
 
 
270 aa  48.5  9e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  25.45 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  26.79 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  22.71 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  25 
 
 
248 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  24.32 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  22.08 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  22.08 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  21.46 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  22.08 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  25.34 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  24.02 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  23.35 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  24.54 
 
 
240 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  24.7 
 
 
236 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  28.71 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>