69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1473 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  100 
 
 		 327 aa  646    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  26.77 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  29.72 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  27.65 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  26.42 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  26.79 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  28.74 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  27.71 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.87 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  25.88 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  28.45 
 
 		 691 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  28.32 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  26.69 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  27.94 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  29.29 
 
 		 679 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  27.87 
 
 		 719 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  24.66 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.32 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  28.46 
 
 		 651 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  26.84 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  27.6 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  26.73 
 
 		 665 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  26.73 
 
 		 665 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  26.73 
 
 		 665 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  29.5 
 
 		 676 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  26.42 
 
 		 664 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  25 
 
 		 651 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  30.15 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  27.78 
 
 		 672 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  23.32 
 
 		 675 aa  49.7  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  25.66 
 
 		 266 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  25.66 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  25.66 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  25.66 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  25.66 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  25.66 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  25.66 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  26.11 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  27.08 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  24.66 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  26.7 
 
 		 711 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  24.58 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  24.67 
 
 		 632 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  24.5 
 
 		 708 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  26.27 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  25.11 
 
 		 289 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2311  hypothetical protein  28.1 
 
 		 254 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  22.98 
 
 		 752 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  23.92 
 
 		 718 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  24.52 
 
 		 687 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  26.26 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0583  membrane protein  27.41 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.7411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  25.78 
 
 		 671 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  23.55 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  26.43 
 
 		 661 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  23.77 
 
 		 697 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  22.93 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  21.71 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  26.38 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1705  hypothetical protein  32.98 
 
 		 255 aa  42.7  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.65 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  24.26 
 
 		 310 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  26.38 
 
 		 289 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  22.68 
 
 		 718 aa  42.7  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  24.76 
 
 		 708 aa  42.7  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  26.38 
 
 		 289 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.35 
 
 		 683 aa  42.7  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  27.97 
 
 		 289 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  28 
 
 		 290 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>