More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0252 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
67 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
67 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 
67 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  95.52 
 
 
67 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  85.07 
 
 
67 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  85.07 
 
 
67 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  82.09 
 
 
67 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  82.09 
 
 
67 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  82.09 
 
 
67 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  82.09 
 
 
67 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  83.58 
 
 
67 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  82.09 
 
 
67 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 
67 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  78.46 
 
 
67 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  78.46 
 
 
67 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  78.46 
 
 
67 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.13 
 
 
67 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 
65 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1502  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
68 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2891  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 
66 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.87323e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
68 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0237  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.63 
 
 
66 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692047  hitchhiker  0.0000000000000296416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  79.69 
 
 
67 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3167  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 
68 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493488  hitchhiker  0.00220171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3392  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 
68 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3185  cold-shock DNA-binding domain protein  78.79 
 
 
66 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000997397  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5852  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 
67 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587256  normal  0.480668 
 
 
 
NC_007517  Gmet_0340  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.12 
 
 
66 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.6796e-20  unclonable  6.2466300000000005e-24 
 
 
 
NC_012918  GM21_1077  cold-shock DNA-binding domain protein  78.79 
 
 
66 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27833e-32 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  76.56 
 
 
67 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2545  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 
67 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242015  decreased coverage  0.000000000715587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0798  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 
68 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000106482  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2520  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 
67 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000000151269  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1909  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 
67 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 
68 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0752  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 
67 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000576972  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  76.56 
 
 
67 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 
67 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1905  cold shock domain-contain protein  78.79 
 
 
66 aa  104  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4020  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 
66 aa  104  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 
67 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
67 aa  104  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0742  cold-shock DNA-binding domain protein  71.21 
 
 
67 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.0000000000219995  unclonable  0.0000000000274746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.73 
 
 
66 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0590  cold-shock protein  71.21 
 
 
67 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000832642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 
66 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1391  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 
66 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000857842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 
66 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0191  cold-shock domain-contain protein  72.73 
 
 
66 aa  103  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.31 
 
 
72 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 
77 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3009  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
66 aa  103  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000338094  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 
68 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2780  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 
67 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000626517  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6765  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
67 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.929729  normal  0.307986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3711  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 
66 aa  103  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000509741  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 
67 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.12 
 
 
66 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0775  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150831  hitchhiker  0.000000000149768 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  69.23 
 
 
67 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2279  cold-shock domain-contain protein  72.31 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000000750079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2791  cold-shock domain-contain protein  71.64 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.827238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2627  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 
66 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368791  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 
67 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0962  cold shock protein  72.31 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000153995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3622  cold-shock domain-contain protein  71.64 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1112  cold shock transcription regulator protein  72.31 
 
 
81 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3609  cold shock transcription regulator protein  71.64 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0434  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3598  CspE-related protein  71.64 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3591  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 
67 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2438  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000000180609  unclonable  0.0000000000176576 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0761  cold-shock domain-contain protein  72.31 
 
 
81 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000025188  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2936  cold-shock domain-contain protein  71.64 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1750  cold-shock domain-contain protein  71.64 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0476  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.528893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 
67 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0574  cold-shock domain-contain protein  72.31 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000358394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1051  cold-shock domain-contain protein  72.31 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117316  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 
170 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2156  cold-shock domain-contain protein  72.31 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000351487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3184  cold-shock domain-contain protein  71.64 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2602  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0673828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3308  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 
66 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0958  cold shock protein  72.31 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000117939  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0408  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125835  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2568  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 
67 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000063088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0503  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 
67 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 
67 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0679  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 
68 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.233328  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
67 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4995  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833631  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2894  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 
67 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0694911  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 
67 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4019  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 
66 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000020604  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 
67 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.76 
 
 
66 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2061  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 
67 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.131927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2202  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
67 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>