14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0084 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  100 
 
 		 999 aa  1905    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  27.07 
 
 		 1186 aa  66.6  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1275 aa  57  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  23.53 
 
 		 1146 aa  55.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  30 
 
 		 1210 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1246 aa  53.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  24.89 
 
 		 1278 aa  52.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  31.65 
 
 		 1331 aa  52.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1146 aa  51.6  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  31.68 
 
 		 1273 aa  50.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  27.84 
 
 		 599 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1247 aa  46.2  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1247 aa  45.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  31.37 
 
 		 1274 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>