55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3225 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3225  abortive infection protein  100 
 
 
344 aa  692    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0165135  normal  0.0503949 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  35.4 
 
 
433 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  33.33 
 
 
351 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  34.67 
 
 
314 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  34.67 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  34.67 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  34.67 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  35.65 
 
 
282 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  33.47 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  24.91 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  24.3 
 
 
286 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  26.3 
 
 
295 aa  77  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  30.61 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  31.97 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  33.57 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  29.58 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  30.33 
 
 
278 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  27.59 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  31.25 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  27.78 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  28.97 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  28.97 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  28.28 
 
 
298 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  27.39 
 
 
324 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  28.97 
 
 
298 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  30.72 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  26.67 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  34.71 
 
 
295 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  28.97 
 
 
233 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  31.25 
 
 
273 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  23.55 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  29.81 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  30.15 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  25.65 
 
 
260 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  32.87 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  29.72 
 
 
309 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  32.28 
 
 
281 aa  56.6  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  28.31 
 
 
291 aa  56.2  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  29.25 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  31.45 
 
 
278 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1065  Abortive infection protein  29.41 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144357  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4219  Abortive infection protein  29.68 
 
 
296 aa  53.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  30 
 
 
301 aa  53.5  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  26.21 
 
 
295 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  28.46 
 
 
283 aa  50.1  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4225  abortive infection protein  37.63 
 
 
253 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.156043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  27.67 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  30.65 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  30.53 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1002  protease, putative  28.07 
 
 
292 aa  47.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000825875  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  26.97 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  32.61 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  32.88 
 
 
319 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3231  abortive infection protein  33.33 
 
 
267 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>