28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1038 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1112  hypothetical protein  52.38 
 
 
195 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.900973  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  42.31 
 
 
221 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  46.67 
 
 
224 aa  101  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.71 
 
 
294 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  36.53 
 
 
189 aa  99  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.74 
 
 
296 aa  94.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  32.92 
 
 
315 aa  90.5  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.29 
 
 
304 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  35.09 
 
 
189 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  35.09 
 
 
189 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  34.5 
 
 
189 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.99 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.76 
 
 
289 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.12 
 
 
322 aa  74.7  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.48 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  30.64 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.64 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  37.18 
 
 
298 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  33.77 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  33.77 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  33.78 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  32.21 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00540  hypothetical protein  41.03 
 
 
111 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.01 
 
 
294 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  31.95 
 
 
292 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  37 
 
 
303 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  30.95 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>