More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_15461 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 86 aa  170  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  96.51 
 
 		 86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  95.35 
 
 		 86 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15061  50S ribosomal protein L27  89.53 
 
 		 86 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.610968  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  83.53 
 
 		 88 aa  145  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  86.9 
 
 		 90 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  86.9 
 
 		 90 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  84.52 
 
 		 88 aa  142  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  81.4 
 
 		 88 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  85.71 
 
 		 88 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 92 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 93 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 86 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  70.24 
 
 		 85 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  67.53 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  72.46 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 87 aa  104  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 93 aa  103  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 94 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0679  ribosomal protein L27  62.82 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000246581  normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 82 aa  103  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0315  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.385897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>