3105 genes were found for organism Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mrub_0001  CDS  NC_013946  37  1356  1320  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003505803  decreased coverage  1.09214e-07  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0002  CDS  NC_013946  1862  2947  1086  DNA polymerase III subunit beta  YP_003505804  hitchhiker  3.20383e-06  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0003  CDS  NC_013946  3114  4388  1275  enolase  YP_003505805  normal  0.0397743  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0004  CDS  NC_013946  4406  5830  1425  pyruvate kinase  YP_003505806  normal  0.328541  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0005  CDS  NC_013946  5855  6997  1143  hypothetical protein  YP_003505807  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0006  CDS  NC_013946  7104  7295  192  hypothetical protein  YP_003505808  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0007  CDS  NC_013946  7292  8032  741  AzlC family protein  YP_003505809  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0008  CDS  NC_013946  8087  8410  324  branched-chain amino acid transport  YP_003505810  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0009  CDS  NC_013946  8407  9276  870  hypothetical protein  YP_003505811  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0010  CDS  NC_013946  9282  10352  1071  Luciferase-like monooxygenase  YP_003505812  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0011  CDS  NC_013946  10411  11421  1011  Polyprenyl synthetase  YP_003505813  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0012  CDS  NC_013946  12401  12622  222  hypothetical protein  YP_003505814  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0013  CDS  NC_013946  12797  13459  663  phage shock protein A, PspA  YP_003505815  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0014  CDS  NC_013946  13538  14296  759  hypothetical protein  YP_003505816  normal  0.822647  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0015  CDS  NC_013946  14322  14795  474  hypothetical protein  YP_003505817  normal  0.474682  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0016  CDS  NC_013946  14805  15485  681  hypothetical protein  YP_003505818  normal  0.390288  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0017  CDS  NC_013946  15590  17449  1860  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  YP_003505819  normal  0.164376  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0018  CDS  NC_013946  17645  17830  186  hypothetical protein  YP_003505820  normal  0.343215  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0019  CDS  NC_013946  17868  18491  624  beta-lactamase domain-containing protein  YP_003505821  normal  0.751358  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0020  CDS  NC_013946  18502  18861  360  Rhodanese domain-containing protein  YP_003505822  normal  0.529293  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0021  CDS  NC_013946  18965  19642  678  glutaredoxin-like domain-containing protein  YP_003505823  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0022  CDS  NC_013946  19639  20007  369  Rhodanese domain-containing protein  YP_003505824  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0023  CDS  NC_013946  20021  20308  288  hypothetical protein  YP_003505825  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0024    NC_013946  20460  20921  462      normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0025  CDS  NC_013946  20909  22066  1158  hypothetical protein  YP_003505826  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0026  CDS  NC_013946  22206  22688  483  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  YP_003505827  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0027  CDS  NC_013946  22681  23748  1068  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  YP_003505828  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0028  CDS  NC_013946  23912  24151  240  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_003505829  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0029  CDS  NC_013946  24199  25482  1284  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003505830  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0030  CDS  NC_013946  25774  26199  426  hypothetical protein  YP_003505831  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0031  CDS  NC_013946  26438  27142  705  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_003505832  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0032  CDS  NC_013946  27163  28434  1272  histidine kinase  YP_003505833  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0033  CDS  NC_013946  28422  29762  1341  histidine kinase  YP_003505834  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0034  CDS  NC_013946  29759  30421  663  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_003505835  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0035  CDS  NC_013946  30591  31055  465  hypothetical protein  YP_003505836  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0036  CDS  NC_013946  31166  31426  261  hypothetical protein  YP_003505837  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0037  CDS  NC_013946  31522  32235  714  intradiol ring-cleavage dioxygenase  YP_003505838  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0038  CDS  NC_013946  32316  33224  909  ApbE family lipoprotein  YP_003505839  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0039  CDS  NC_013946  33221  33757  537  periplasmic protein  YP_003505840  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0040  CDS  NC_013946  33741  34367  627  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  YP_003505841  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0041  CDS  NC_013946  34357  36069  1713  hypothetical protein  YP_003505842  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0042  CDS  NC_013946  36078  36269  192  hypothetical protein  YP_003505843  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0043  CDS  NC_013946  36340  37152  813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003505844  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0044  CDS  NC_013946  37152  38066  915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003505845  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0045  CDS  NC_013946  38205  39449  1245  extracellular solute-binding protein family 1  YP_003505846  normal  0.713374  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0046  CDS  NC_013946  39626  40051  426  hypothetical protein  YP_003505847  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0047  CDS  NC_013946  40126  41331  1206  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003505848  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0048  CDS  NC_013946  41328  41819  492  Appr-1-p processing domain-containing protein  YP_003505849  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0049  CDS  NC_013946  41858  42160  303  Tchh; trichohyalin  YP_003505850  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0050  CDS  NC_013946  42157  42591  435  PilT domain-containing protein  YP_003505851  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0051  CDS  NC_013946  42588  43694  1107  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  YP_003505852  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0052  CDS  NC_013946  43702  44505  804  metallophosphoesterase  YP_003505853  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0053  CDS  NC_013946  44519  45106  588  Chromate transporter  YP_003505854  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0054  CDS  NC_013946  45099  45617  519  Chromate transporter  YP_003505855  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0055  CDS  NC_013946  45628  46428  801  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003505856  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0056  CDS  NC_013946  46558  47445  888  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003505857  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0057  CDS  NC_013946  47645  48610  966  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003505858  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0058  CDS  NC_013946  48607  49599  993  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003505859  normal  normal  0.82394  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0059  CDS  NC_013946  49619  50602  984  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003505860  normal  normal  0.821201  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0060  CDS  NC_013946  50784  52025  1242  hypothetical protein  YP_003505861  normal  normal  0.839104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0061  CDS  NC_013946  52054  53451  1398  metal dependent phosphohydrolase  YP_003505862  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0062  CDS  NC_013946  53507  54226  720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003505863  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0063  CDS  NC_013946  54264  54785  522  ATP-cone domain-containing protein  YP_003505864  normal  normal  0.987989  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0064  CDS  NC_013946  54821  55558  738  hypothetical protein  YP_003505865  normal  normal  0.604985  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0065  CDS  NC_013946  55575  56066  492  NUDIX hydrolase  YP_003505866  normal  normal  0.783309  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0066  CDS  NC_013946  56244  56522  279  hypothetical protein  YP_003505867  normal  0.859695  normal  0.738007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0067  CDS  NC_013946  56527  57291  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003505868  normal  0.43127  normal  0.598293  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0068  CDS  NC_013946  57383  57637  255  AbrB family transcriptional regulator  YP_003505869  normal  0.499892  normal  0.748318  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0069  CDS  NC_013946  57630  57875  246  hypothetical protein  YP_003505870  normal  0.508725  normal  0.755848  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0070  CDS  NC_013946  58025  58906  882  N-carbamoylputrescine amidase  YP_003505871  normal  0.564208  normal  0.664362  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0071  CDS  NC_013946  58917  59963  1047  Agmatine deiminase  YP_003505872  normal  0.73105  normal  0.685593  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0072  CDS  NC_013946  59993  61099  1107  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  YP_003505873  normal  0.152477  normal  0.89732  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0073  CDS  NC_013946  61134  61367  234  hypothetical protein  YP_003505874  normal  0.0766024  normal  0.7592  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0074  CDS  NC_013946  61368  62000  633  Phosphoglycerate mutase  YP_003505875  normal  0.107325  normal  0.82394  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0075  CDS  NC_013946  62016  63023  1008  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  YP_003505876  normal  0.496128  normal  0.888939  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0076  CDS  NC_013946  63020  64444  1425  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase B subunit  YP_003505877  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0077  CDS  NC_013946  64795  65304  510  Lytic transglycosylase catalytic  YP_003505878  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0078  CDS  NC_013946  65613  66083  471  hypothetical protein  YP_003505879  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0079  CDS  NC_013946  66062  66259  198  hypothetical protein  YP_003505880  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0080  CDS  NC_013946  66368  66790  423  hypothetical protein  YP_003505881  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0081  CDS  NC_013946  67303  67581  279  hypothetical protein  YP_003505882  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0082  CDS  NC_013946  67571  67762  192  hypothetical protein  YP_003505883  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0083  CDS  NC_013946  67762  68403  642  hypothetical protein  YP_003505884  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0084  CDS  NC_013946  68390  68731  342  hypothetical protein  YP_003505885  normal  normal  0.743744  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0085  CDS  NC_013946  68733  69071  339  hypothetical protein  YP_003505886  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0086  CDS  NC_013946  69086  69961  876  hypothetical protein  YP_003505887  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0087  CDS  NC_013946  69974  70483  510  hypothetical protein  YP_003505888  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0088  CDS  NC_013946  70499  70915  417  hypothetical protein  YP_003505889  normal  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0089  CDS  NC_013946  71064  71738  675  hypothetical protein  YP_003505890  normal  normal  0.800065  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0090  CDS  NC_013946  72362  72556  195  hypothetical protein  YP_003505891  normal  normal  0.41106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0091  CDS  NC_013946  72553  73122  570  cell wall hydrolase/autolysin  YP_003505892  normal  normal  0.421646  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0092  CDS  NC_013946  73070  73402  333  hypothetical protein  YP_003505893  normal  normal  0.408861  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0093  CDS  NC_013946  73521  73934  414  hypothetical protein  YP_003505894  normal  normal  0.553961  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0094  CDS  NC_013946  73938  74450  513  hypothetical protein  YP_003505895  normal  normal  0.569624  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0095  CDS  NC_013946  74556  74849  294  hypothetical protein  YP_003505896  normal  normal  0.725323  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0096  CDS  NC_013946  74854  75225  372  hypothetical protein  YP_003505897  normal  normal  0.527917  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0097  CDS  NC_013946  75307  75813  507  hypothetical protein  YP_003505898  normal  normal  0.418273  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0098  CDS  NC_013946  75820  78300  2481  ATP-dependent helicase HrpB  YP_003505899  normal  normal  0.310548  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0099  CDS  NC_013946  78367  78588  222  hypothetical protein  YP_003505900  normal  normal  0.18259  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0100  CDS  NC_013946  78721  78924  204  hypothetical protein  YP_003505901  normal  normal  0.127451  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>