33 genes were found for organism Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
SEA0001  CDS  NC_006663  78  815  738  replication-associated protein  YP_187530  hitchhiker  0.00729904  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0002  CDS  NC_006663  988  1632  645  truncated IS431mec-like transposase  YP_187531  hitchhiker  0.00153541  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0003  CDS  NC_006663  1699  2544  846  beta-lactamase  YP_187532  decreased coverage  0.000347481  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0004  CDS  NC_006663  2651  4408  1758  regulatory protein BlaR1  YP_187533  normal  0.0356117  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0005  CDS  NC_006663  4425  4778  354  penicillinase repressor  YP_187534  normal  0.014635  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0006  CDS  NC_006663  5042  5620  579  resolvase family site-specific recombinase  YP_187535  normal  0.105184  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0007  CDS  NC_006663  5952  6095  144  hypothetical protein  YP_187536  normal  0.182868  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0008  CDS  NC_006663  6361  7035  675  IS431mec-like transposase  YP_187537  normal  0.297638  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0009  CDS  NC_006663  7077  7412  336  transcriptional regulator, putative  YP_187538  normal  0.227571  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0010  CDS  NC_006663  7688  8482  795  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  YP_187539  normal  0.590749  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0011  CDS  NC_006663  8575  9117  543  streptothricin acetyltransferase  YP_187540  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0012  CDS  NC_006663  9114  9953  840  aminoglycoside 6-adenylyltransferase  YP_187541  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0013  CDS  NC_006663  9967  10080  114  hypothetical protein  YP_187542  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0014  CDS  NC_006663  10055  10789  735  UbiE/COQ5 family methlytransferase  YP_187543  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0015  CDS  NC_006663  10770  11639  870  hypothetical protein  YP_187544  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0016  CDS  NC_006663  12009  12659  651  TetR family transcriptional regulator  YP_187545  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0017  CDS  NC_006663  12669  13799  1131  ABC transporter, permease protein  YP_187546  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0018  CDS  NC_006663  13801  14505  705  ABC transporter, ATP-binding protein  YP_187547  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0019  CDS  NC_006663  14756  15649  894  hypothetical protein  YP_187548  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0020  CDS  NC_006663  15693  16367  675  IS431mec-like transposase  YP_187549  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0021  CDS  NC_006663  16413  17039  627  truncated IS431mec-like transposase  YP_187550  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0022  CDS  NC_006663  17239  17883  645  truncated replication protein  YP_187551  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0023  CDS  NC_006663  19178  19591  414  universal stress protein  YP_187552  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0024  CDS  NC_006663  19605  21056  1452  sulfate permease family protein  YP_187553  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0025  CDS  NC_006663  21170  21712  543  resolvase, putative  YP_187554  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0026  CDS  NC_006663  21798  22031  234  hypothetical protein  YP_187555  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0027  CDS  NC_006663  22328  22723  396  mobilization protein  YP_187556  normal  0.99589  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0028  CDS  NC_006663  22705  22905  201  hypothetical protein  YP_187557  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0029  CDS  NC_006663  22883  23899  1017  rlx protein, putative  YP_187558  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0030  CDS  NC_006663  23601  24407  807  mobilization protein  YP_187559  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0031  CDS  NC_006663  24376  24567  192  hypothetical protein  YP_187560  normal  0.544799  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0032    NC_006663  24914  25588  675      normal  0.195097  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0033  CDS  NC_006663  26046  27080  1035  replication-associated protein RepA  YP_187561  normal  0.34337  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>