172 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Athe_0066  CDS  NC_012034  84053  84691  +  639  hypothetical protein  YP_002572001  unclonable  0.000000000122111  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0067  CDS  NC_012034  84805  85776  +  972  hypothetical protein  YP_002572002  unclonable  0.000000000700421  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0068  CDS  NC_012034  85816  86733  +  918  Abortive infection protein  YP_002572003  unclonable  0.000000000858649  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0069  CDS  NC_012034  86795  87088  +  294  hypothetical protein  YP_002572004  unclonable  0.0000000000577809  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0070  CDS  NC_012034  87091  87198  +  108  hypothetical protein  YP_002572005  unclonable  0.0000000000232176  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0071    NC_012034  87295  88243  +  949      unclonable  0.00000000108711  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0146  CDS  NC_012034  183496  184248  +  753  transcriptional regulator, DeoR family  YP_002572071  unclonable  0.000000000230525  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0161  CDS  NC_012034  200857  202029  -  1173  hypothetical protein  YP_002572086  unclonable  0.00000000158146  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0172  CDS  NC_012034  210640  211497  +  858  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  YP_002572097  unclonable  0.00000000123849  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0173  CDS  NC_012034  211556  211798  -  243  transcriptional regulator, AbrB family  YP_002572098  unclonable  0.0000000000901689  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0202  CDS  NC_012034  248287  250515  +  2229  ABC transporter related  YP_002572126  unclonable  0.000000528171  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0272  CDS  NC_012034  319469  319930  +  462  PilT protein domain protein  YP_002572193  unclonable  0.0000000000977844  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0347  CDS  NC_012034  401175  401912  +  738  hypothetical protein  YP_002572256  unclonable  0.000000000601753  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0348  CDS  NC_012034  402162  402980  +  819  hypothetical protein  YP_002572257  unclonable  0.000000000700421  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0351  CDS  NC_012034  405020  405766  +  747  hypothetical protein  YP_002572260  unclonable  0.00000000043926  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0352  CDS  NC_012034  405771  406493  +  723  hypothetical protein  YP_002572261  unclonable  0.00000000052743  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0353  CDS  NC_012034  406744  407556  +  813  hypothetical protein  YP_002572262  unclonable  0.00000000063307  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0354  CDS  NC_012034  408060  408974  +  915  hypothetical protein  YP_002572263  unclonable  0.000000000914442  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0355  CDS  NC_012034  409290  410171  +  882  hypothetical protein  YP_002572264  unclonable  0.000000000858649  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0356  CDS  NC_012034  410241  410375  +  135  hypothetical protein  YP_002572265  unclonable  0.0000000000272846  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0373  CDS  NC_012034  425493  426755  +  1263  thiamine biosynthesis protein ThiC  YP_002572282  unclonable  0.00000000321341  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0374    NC_012034  426973  428235  +  1263      unclonable  0.00000000232294  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0388  CDS  NC_012034  440670  441101  +  432  GtrA family protein  YP_002572295  unclonable  0.0000000000665591  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0389  CDS  NC_012034  441119  442330  +  1212  hypothetical protein  YP_002572296  unclonable  0.00000000244478  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0399  CDS  NC_012034  458758  459984  +  1227  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002572306  unclonable  0.00000000195685  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0400  CDS  NC_012034  460084  460971  +  888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002572307  unclonable  0.000000000506379  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0401  CDS  NC_012034  461015  461848  +  834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002572308  unclonable  0.000000000457855  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0402  CDS  NC_012034  461939  462958  +  1020  transcriptional regulator, LacI family  YP_002572309  unclonable  0.00000000159796  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0464  CDS  NC_012034  530731  534150  -  3420  Non-specific serine/threonine protein kinase  YP_002572369  unclonable  0.0000898251  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0472  CDS  NC_012034  542442  543176  +  735  protein of unknown function DUF541  YP_002572377  unclonable  0.000000000443999  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0481  CDS  NC_012034  552113  553495  +  1383  hypothetical protein  YP_002572385  unclonable  0.00000000859311  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0525  CDS  NC_012034  593022  594029  +  1008  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  YP_002572424  unclonable  0.00000000187732  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0526  CDS  NC_012034  594058  594753  +  696  transcriptional regulator, GntR family  YP_002572425  unclonable  0.000000000481506  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0527  CDS  NC_012034  594852  597077  +  2226  Mur ligase middle domain protein  YP_002572426  unclonable  0.000000448446  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0528  CDS  NC_012034  597154  597441  +  288  hypothetical protein  YP_002572427  unclonable  0.0000000000620149  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0529  CDS  NC_012034  597888  598295  +  408  hypothetical protein  YP_002572428  unclonable  0.0000000000866022  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0621  CDS  NC_012034  705814  706785  +  972  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  YP_002572518  unclonable  0.00000000156456  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0623  CDS  NC_012034  707210  708571  +  1362  Radical SAM domain protein  YP_002572520  unclonable  0.00000000646743  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0624  CDS  NC_012034  708573  709088  +  516  carbonic anhydrase  YP_002572521  unclonable  0.00000000010495  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0625  CDS  NC_012034  709214  710461  +  1248  preprotein translocase subunit SecD  YP_002572522  unclonable  0.00000000418015  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0645  CDS  NC_012034  732739  733581  -  843  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  YP_002572542  unclonable  0.0000000010542  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0646  CDS  NC_012034  733750  734034  +  285  hypothetical protein  YP_002572543  unclonable  0.0000000000480732  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0647  CDS  NC_012034  734068  734838  +  771  MazG family protein  YP_002572544  unclonable  0.000000000543691  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0648  CDS  NC_012034  734927  735202  +  276  histone family protein DNA-binding protein  YP_002572545  unclonable  0.0000000000417185  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0655  CDS  NC_012034  737787  739268  +  1482  threonine synthase  YP_002572552  unclonable  0.0000000123828  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0656  CDS  NC_012034  739854  741107  +  1254  MgtE intracellular region  YP_002572553  unclonable  0.0000000076098  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0657  CDS  NC_012034  741141  742388  +  1248  natural resistance-associated macrophage protein  YP_002572554  unclonable  0.00000000666945  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0682    NC_012034  765674  766264  +  591      unclonable  0.000000000417685  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0743  CDS  NC_012034  830480  831412  +  933  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  YP_002572631  unclonable  0.000000000924316  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0744  CDS  NC_012034  833171  833383  +  213  helix-turn-helix domain protein  YP_002572632  unclonable  0.0000000000327469  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0783  CDS  NC_012034  872783  873865  +  1083  cell division protein FtsZ  YP_002572671  unclonable  0.00000000321341  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0805  CDS  NC_012034  899351  902842  +  3492  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  YP_002572693  unclonable  0.0000908086  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0806  CDS  NC_012034  903022  903276  +  255  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  YP_002572694  unclonable  0.0000000000124413  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0807  CDS  NC_012034  903300  903737  +  438  30S ribosomal protein S12  YP_002572695  unclonable  0.000000000025178  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0808  CDS  NC_012034  903805  904278  +  474  30S ribosomal protein S7  YP_002572696  unclonable  0.0000000000412886  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0809  CDS  NC_012034  904308  906383  +  2076  elongation factor G  YP_002572697  unclonable  0.0000000920124  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0841  CDS  NC_012034  932171  933592  +  1422  carbohydrate kinase FGGY  YP_002572729  unclonable  0.0000000141344  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0884  CDS  NC_012034  983861  985147  +  1287  amidohydrolase  YP_002572767  unclonable  0.00000000393523  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0890  CDS  NC_012034  990500  993580  +  3081  MMPL domain protein  YP_002572773  unclonable  0.0000250771  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0934  CDS  NC_012034  1035147  1037474  +  2328  ATP-dependent protease La  YP_002572812  unclonable  0.00000076135  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0954  CDS  NC_012034  1056337  1060401  +  4065  hypothetical protein  YP_002572831  unclonable  0.000910199  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0967  CDS  NC_012034  1071625  1072956  +  1332  signal recognition particle protein  YP_002572843  unclonable  0.0000000109658  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0968  CDS  NC_012034  1072990  1073235  +  246  30S ribosomal protein S16  YP_002572844  unclonable  0.000000000054377  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0969  CDS  NC_012034  1073264  1073497  +  234  RNA-binding protein  YP_002572845  unclonable  0.0000000000537782  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0970  CDS  NC_012034  1073547  1074056  +  510  16S rRNA-processing protein RimM  YP_002572846  unclonable  0.00000000015249  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0971    NC_012034  1074059  1074797  +  739      unclonable  0.000000000443999  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0983  CDS  NC_012034  1085467  1086789  +  1323  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  YP_002572857  unclonable  0.00000000730864  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0984  CDS  NC_012034  1086789  1087337  +  549  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  YP_002572858  unclonable  0.000000000155627  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_0985  CDS  NC_012034  1087349  1088584  +  1236  competence/damage-inducible protein CinA  YP_002572859  unclonable  0.00000000422375  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1048  CDS  NC_012034  1142733  1143188  +  456  hypothetical protein  YP_002572922  unclonable  0.000000000120853  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1049  CDS  NC_012034  1143218  1144291  +  1074  NusA antitermination factor  YP_002572923  unclonable  0.00000000259791  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1063  CDS  NC_012034  1158451  1160121  +  1671  transcription termination factor Rho  YP_002572937  unclonable  0.0000000384674  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1149  CDS  NC_012034  1243226  1243543  +  318  hypothetical protein  YP_002573023  unclonable  0.0000000000220773  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1235  CDS  NC_012034  1324177  1325064  +  888  beta-lactamase domain protein  YP_002573108  unclonable  0.000000000521991  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1258  CDS  NC_012034  1349302  1349823  +  522  protein of unknown function DUF177  YP_002573131  unclonable  0.000000000135148  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1267  CDS  NC_012034  1358519  1358938  +  420  thioesterase superfamily protein  YP_002573140  unclonable  0.0000000000790915  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1286  CDS  NC_012034  1377966  1378445  +  480  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase related  YP_002573159  unclonable  0.000000000122111  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1305  CDS  NC_012034  1396057  1396704  +  648  septum site-determining protein MinC  YP_002573178  unclonable  0.000000000196227  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1341  CDS  NC_012034  1427383  1428435  +  1053  hypothetical protein  YP_002573214  unclonable  0.00000000130295  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1364  CDS  NC_012034  1448447  1452013  +  3567  von Willebrand factor type A  YP_002573237  unclonable  0.000145336  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1407  CDS  NC_012034  1490703  1491725  -  1023  transcriptional regulator, DeoR family  YP_002573278  unclonable  0.00000000156456  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1408  CDS  NC_012034  1491709  1491846  -  138  hypothetical protein  YP_002573279  unclonable  0.0000000000209932  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1409  CDS  NC_012034  1491882  1494533  -  2652  pyruvate phosphate dikinase  YP_002573280  unclonable  0.00000166258  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1495  CDS  NC_012034  1578059  1578727  +  669  LexA repressor  YP_002573366  unclonable  0.000000000262911  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1527  CDS  NC_012034  1617854  1618225  -  372  hypothetical protein  YP_002573398  unclonable  0.0000000000327469  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1528  CDS  NC_012034  1618359  1618748  -  390  ribosomal protein L7/L12  YP_002573399  unclonable  0.000000000020563  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1529  CDS  NC_012034  1618787  1619338  -  552  ribosomal protein L10  YP_002573400  unclonable  0.0000000000554953  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1530  CDS  NC_012034  1619555  1620247  -  693  50S ribosomal protein L1  YP_002573401  unclonable  0.000000000127232  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1531  CDS  NC_012034  1620324  1620749  -  426  50S ribosomal protein L11  YP_002573402  unclonable  0.0000000000330995  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1532  CDS  NC_012034  1620791  1621315  -  525  NusG antitermination factor  YP_002573403  unclonable  0.0000000000537782  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1533  CDS  NC_012034  1621363  1621632  -  270  preprotein translocase, SecE subunit  YP_002573404  unclonable  0.0000000000234675  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1600  CDS  NC_012034  1695063  1697957  -  2895  protein of unknown function DUF1156  YP_002573467  unclonable  0.00000970911  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1659  CDS  NC_012034  1752893  1753696  -  804  hypothetical protein  YP_002573526  unclonable  0.000000000877289  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1726  CDS  NC_012034  1810809  1812116  -  1308  preprotein translocase, SecY subunit  YP_002573593  unclonable  0.00000000716119  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1727  CDS  NC_012034  1812118  1812561  -  444  50S ribosomal protein L15  YP_002573594  unclonable  0.0000000000774697  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1728  CDS  NC_012034  1812582  1813088  -  507  30S ribosomal protein S5  YP_002573595  unclonable  0.000000000123427  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1729  CDS  NC_012034  1813109  1813483  -  375  50S ribosomal protein L18  YP_002573596  unclonable  0.0000000000500708  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1730  CDS  NC_012034  1813494  1814042  -  549  50S ribosomal protein L6  YP_002573597  unclonable  0.0000000000672522  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1731  CDS  NC_012034  1814073  1814471  -  399  30S ribosomal protein S8  YP_002573598  unclonable  0.0000000000337802  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Athe_1732  CDS  NC_012034  1814499  1814684  -  186  30S ribosomal protein S14  YP_002573599  unclonable  0.0000000000129581  n/a    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>