80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3638 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3638  primosomal replication protein N  100 
 
 		 105 aa  216  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0795  primosomal replication protein N  84.76 
 
 		 106 aa  193  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00210867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3434  primosomal replication protein N  84.76 
 
 		 106 aa  192  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0112782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3591  primosomal replication protein N  83.81 
 
 		 106 aa  191  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0775  primosomal replication protein N  81.9 
 
 		 106 aa  184  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000117168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04068  primosomal replication protein N  78.64 
 
 		 104 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04030  hypothetical protein  78.64 
 
 		 104 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4445  primosomal replication protein N  78.64 
 
 		 104 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4762  primosomal replication protein N  78.64 
 
 		 104 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0447  primosomal replication protein N  80 
 
 		 105 aa  182  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00438662 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3812  primosomal replication protein N  78.64 
 
 		 104 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0549783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4734  primosomal replication protein N  78.64 
 
 		 104 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.207424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3792  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  77.67 
 
 		 104 aa  181  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00701576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0372  primosomal replication protein N  76.7 
 
 		 104 aa  180  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0387347  normal  0.0311517 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4752  primosomal replication protein N  76.7 
 
 		 104 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.289181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4810  primosomal replication protein N  76.7 
 
 		 104 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0747628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4660  primosomal replication protein N  76.7 
 
 		 104 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.514563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4670  primosomal replication protein N  76.7 
 
 		 104 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0146499  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4788  primosomal replication protein N  76.7 
 
 		 104 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0989089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0573  primosomal replication protein N  66.02 
 
 		 117 aa  152  1e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.380411  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2765  primosomal replication protein N  61.62 
 
 		 100 aa  134  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.941899  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1437  primosomal replication protein N  59.6 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000292686  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002333  primosomal replication protein N  57.29 
 
 		 100 aa  117  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.143952  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3783  primosomal replication protein N  100 
 
 		 55 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2778  primosomal replication protein N  54.55 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000941139  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00022  primosomal replication protein N  58.24 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3585  primosomal replication protein N  45 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0804517  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3420  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  48.94 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4211  primosomal replication protein N  44 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.493289  hitchhiker  0.000256968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0416  primosomal replication protein N  46.46 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3642  primosomal replication protein N  41 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00121069  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0712  primosomal replication protein N  41 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127326  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0742  primosomal replication protein N  41 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000754533  hitchhiker  0.000130269 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0733  primosomal replication protein N  41 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110902  hitchhiker  0.0000000106938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3929  primosomal replication protein N  41 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0758  primosomal replication protein N  44 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208555  hitchhiker  0.00000145919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0754  primosomal replication protein N  41 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000514049  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0516  primosomal replication protein N  42.86 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.321631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3350  primosomal replication protein N  43.62 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000006513  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3063  primosomal replication protein N  42.11 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451592  normal  0.213794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0702  primosomal replication protein N  37.89 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00024455  hitchhiker  0.000386663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3259  primosomal replication protein N  37.89 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0688  primosomal replication protein N  37.89 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000362584  hitchhiker  0.000302013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3283  single-strand binding protein/primosomal replication protein N  41.43 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0141389  hitchhiker  0.000204864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0583  restart primosome assembly protein PriB  30.39 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.468421  hitchhiker  0.00000000000001016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1327  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  33.66 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.572179  normal  0.882233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3668  primosomal replication protein N  34 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0691309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2104  restart primosome assembly protein PriB  31.63 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.474757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5228  putative primosomal replication protein  30.21 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2568  putative primosomal replication protein  28.87 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3215  putative primosomal replication protein  28.87 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  25.45 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2180  primosomal replication protein n  34.78 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2415  primosomal replication protein n  34.78 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.409053  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1894  primosomal replication protein n  34.78 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1403  primosomal replication protein n  34.78 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263355  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0982  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  31.25 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.61218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0003  primosomal replication protein n  34.78 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2251  primosomal replication protein n  34.78 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2290  primosomal replication protein n  34.78 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0526729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1167  primosomal replication protein n  34.78 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.246726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1896  primosomal replication protein N-like protein  35.87 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00667107  hitchhiker  0.0000000544917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0912  putative primosomal replication protein N, PriB  33.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768377  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5173  primosomal replication protein N-like  34.78 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1873  primosomal replication protein N-like protein  34.78 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6206  primosomal replication protein N-like  34.78 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.622394  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2455  putative primosomal replication protein N, PriB  34.34 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0486378  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1787  putative primosomal replication protein N, PriB  34.34 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729051  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  28.04 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1782  primosomal replication protein N-like protein  34.78 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1229  putative primosomal replication protein  29.17 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250419 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1810  primosomal replication protein N-like protein  34.78 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2194  putative primosomal replication protein  28.57 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0257375  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1950  primosomal replication protein N  29.7 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.696945  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1819  putative primosomal replication protein  30.67 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1401  primosomal replication protein N-like protein  30.77 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2394  putative primosomal replication protein  28.95 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  27.03 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3036  putative primosomal replication protein  28.12 
 
 		 99 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  23.64 
 
 		 151 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>