42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1819 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1819  putative primosomal replication protein  100 
 
 		 91 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2194  putative primosomal replication protein  68.13 
 
 		 99 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0257375  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2568  putative primosomal replication protein  65.93 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3215  putative primosomal replication protein  65.93 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5228  putative primosomal replication protein  65.56 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0982  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  66.29 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.61218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1229  putative primosomal replication protein  67.78 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250419 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2394  putative primosomal replication protein  55.29 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3036  putative primosomal replication protein  53.93 
 
 		 99 aa  94  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1527  restart primosome assembly protein PriB  51.28 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026156  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2829  primosomal replication protein N  44.32 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1810  primosomal replication protein N-like protein  43.62 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179262  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1782  primosomal replication protein N-like protein  43.62 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1401  primosomal replication protein N-like protein  43.62 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5173  primosomal replication protein N-like  42.55 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1896  primosomal replication protein N-like protein  42.55 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00667107  hitchhiker  0.0000000544917 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1403  primosomal replication protein n  44.68 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1167  primosomal replication protein n  44.68 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.246726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2290  primosomal replication protein n  44.68 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0526729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2251  primosomal replication protein n  44.68 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128853  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0912  putative primosomal replication protein N, PriB  43.82 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768377  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0003  primosomal replication protein n  44.68 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1787  putative primosomal replication protein N, PriB  43.62 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729051  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1873  primosomal replication protein N-like protein  42.7 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6206  primosomal replication protein N-like  42.7 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.622394  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2415  primosomal replication protein n  44.68 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.409053  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1894  primosomal replication protein n  44.68 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2455  putative primosomal replication protein N, PriB  43.62 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0486378  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3668  primosomal replication protein N  43.82 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0691309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2180  primosomal replication protein n  43.62 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1950  primosomal replication protein N  44.44 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.696945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2005  restart primosome assembly protein PriB  40 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1978  restart primosome assembly protein PriB  38.3 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.874334  normal  0.100205 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0421  putative primosomal replication protein N, PriB  35.96 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494605  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1327  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  36.67 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.572179  normal  0.882233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1217  primosomal replication protein N  35.44 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1308  hypothetical protein  36.47 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1183  hypothetical protein  34.12 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00555976  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1244  hypothetical protein  34.12 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0190139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2104  restart primosome assembly protein PriB  27.17 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.474757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3638  primosomal replication protein N  30.67 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0795  primosomal replication protein N  26.67 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00210867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>