42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1244 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1244  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  223  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0190139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1183  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  223  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00555976  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1308  hypothetical protein  87.96 
 
 		 108 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2005  restart primosome assembly protein PriB  62.63 
 
 		 99 aa  140  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1978  restart primosome assembly protein PriB  56.57 
 
 		 99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.874334  normal  0.100205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1787  putative primosomal replication protein N, PriB  48.48 
 
 		 99 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729051  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2455  putative primosomal replication protein N, PriB  48.48 
 
 		 99 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0486378  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0912  putative primosomal replication protein N, PriB  48.48 
 
 		 99 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768377  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1894  primosomal replication protein n  46.46 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1167  primosomal replication protein n  46.46 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.246726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2290  primosomal replication protein n  46.46 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0526729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2251  primosomal replication protein n  46.46 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0003  primosomal replication protein n  46.46 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1403  primosomal replication protein n  46.46 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263355  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2415  primosomal replication protein n  46.46 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.409053  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2180  primosomal replication protein n  45.45 
 
 		 99 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1401  primosomal replication protein N-like protein  45.45 
 
 		 99 aa  89.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5173  primosomal replication protein N-like  45.45 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1896  primosomal replication protein N-like protein  45.45 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00667107  hitchhiker  0.0000000544917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1873  primosomal replication protein N-like protein  45.45 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6206  primosomal replication protein N-like  45.45 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.622394  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1782  primosomal replication protein N-like protein  45.45 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1810  primosomal replication protein N-like protein  45.45 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179262  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2829  primosomal replication protein N  43.96 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0421  putative primosomal replication protein N, PriB  40.66 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3668  primosomal replication protein N  36.46 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0691309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2394  putative primosomal replication protein  34.04 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1327  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  34.07 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.572179  normal  0.882233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3215  putative primosomal replication protein  42.22 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2568  putative primosomal replication protein  42.22 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3036  putative primosomal replication protein  35.11 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5228  putative primosomal replication protein  39.33 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1950  primosomal replication protein N  34.44 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.696945  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2194  putative primosomal replication protein  36.17 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0257375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2104  restart primosome assembly protein PriB  37.08 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.474757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1527  restart primosome assembly protein PriB  35.53 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026156  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1217  primosomal replication protein N  36.84 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1229  putative primosomal replication protein  38.2 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0982  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  37.08 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.61218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0429  putative primosomal replication protein N, PriB  39.39 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.494464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1819  putative primosomal replication protein  34.12 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0583  restart primosome assembly protein PriB  37.18 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.468421  hitchhiker  0.00000000000001016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>