35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0429 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0429  putative primosomal replication protein N, PriB  100 
 
 		 72 aa  150  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.494464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0421  putative primosomal replication protein N, PriB  91.67 
 
 		 97 aa  139  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494605  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0912  putative primosomal replication protein N, PriB  40.3 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768377  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1401  primosomal replication protein N-like protein  41.54 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2005  restart primosome assembly protein PriB  42.42 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1896  primosomal replication protein N-like protein  38.81 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00667107  hitchhiker  0.0000000544917 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5173  primosomal replication protein N-like  38.81 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1873  primosomal replication protein N-like protein  38.81 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6206  primosomal replication protein N-like  38.81 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.622394  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1787  putative primosomal replication protein N, PriB  38.81 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729051  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2455  putative primosomal replication protein N, PriB  38.81 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0486378  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1810  primosomal replication protein N-like protein  38.81 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179262  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1782  primosomal replication protein N-like protein  38.81 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1894  primosomal replication protein n  38.46 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0003  primosomal replication protein n  38.46 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2251  primosomal replication protein n  38.46 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2290  primosomal replication protein n  38.46 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0526729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1167  primosomal replication protein n  38.46 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.246726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2415  primosomal replication protein n  38.46 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.409053  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1403  primosomal replication protein n  38.46 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2180  primosomal replication protein n  36.92 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1978  restart primosome assembly protein PriB  39.13 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.874334  normal  0.100205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5228  putative primosomal replication protein  40 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1308  hypothetical protein  39.39 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1244  hypothetical protein  39.39 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0190139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1183  hypothetical protein  39.39 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00555976  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1327  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  29.23 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.572179  normal  0.882233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3215  putative primosomal replication protein  38.57 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2568  putative primosomal replication protein  38.57 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1229  putative primosomal replication protein  43.28 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2829  primosomal replication protein N  33.33 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0982  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  34.33 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.61218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3668  primosomal replication protein N  31.34 
 
 		 104 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0691309  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1527  restart primosome assembly protein PriB  31.34 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026156  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2194  putative primosomal replication protein  31.43 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0257375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>