59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1782 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1810  primosomal replication protein N-like protein  100 
 
 		 99 aa  200  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179262  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1782  primosomal replication protein N-like protein  100 
 
 		 99 aa  200  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5173  primosomal replication protein N-like  98.99 
 
 		 99 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1896  primosomal replication protein N-like protein  97.98 
 
 		 99 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00667107  hitchhiker  0.0000000544917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1873  primosomal replication protein N-like protein  97.98 
 
 		 99 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6206  primosomal replication protein N-like  97.98 
 
 		 99 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.622394  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1401  primosomal replication protein N-like protein  93.94 
 
 		 99 aa  187  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2455  putative primosomal replication protein N, PriB  88.89 
 
 		 99 aa  181  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0486378  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0003  primosomal replication protein n  91.92 
 
 		 99 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2251  primosomal replication protein n  91.92 
 
 		 99 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1894  primosomal replication protein n  91.92 
 
 		 99 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2290  primosomal replication protein n  91.92 
 
 		 99 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0526729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1167  primosomal replication protein n  91.92 
 
 		 99 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.246726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2415  primosomal replication protein n  91.92 
 
 		 99 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.409053  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1787  putative primosomal replication protein N, PriB  88.89 
 
 		 99 aa  181  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729051  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1403  primosomal replication protein n  91.92 
 
 		 99 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2180  primosomal replication protein n  89.9 
 
 		 99 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0912  putative primosomal replication protein N, PriB  85.86 
 
 		 99 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768377  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1978  restart primosome assembly protein PriB  49.49 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.874334  normal  0.100205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2005  restart primosome assembly protein PriB  46.46 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1183  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00555976  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1244  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0190139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3036  putative primosomal replication protein  43.75 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0421  putative primosomal replication protein N, PriB  40.43 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2394  putative primosomal replication protein  46.81 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1308  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1327  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  40.62 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.572179  normal  0.882233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3668  primosomal replication protein N  42.55 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0691309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2829  primosomal replication protein N  44.09 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3215  putative primosomal replication protein  42.86 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2568  putative primosomal replication protein  42.86 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2194  putative primosomal replication protein  42.55 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0257375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0982  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  41.94 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.61218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1229  putative primosomal replication protein  44.44 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1217  primosomal replication protein N  43.04 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5228  putative primosomal replication protein  40.82 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1819  putative primosomal replication protein  43.62 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2104  restart primosome assembly protein PriB  35.23 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.474757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1950  primosomal replication protein N  34.38 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.696945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1527  restart primosome assembly protein PriB  40.79 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026156  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0429  putative primosomal replication protein N, PriB  38.81 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.494464 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0583  restart primosome assembly protein PriB  34.57 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.468421  hitchhiker  0.00000000000001016 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2778  primosomal replication protein N  38.38 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000941139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3063  primosomal replication protein N  35.63 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451592  normal  0.213794 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2765  primosomal replication protein N  32.94 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.941899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0447  primosomal replication protein N  29.67 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00438662 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3638  primosomal replication protein N  34.78 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3591  primosomal replication protein N  31.18 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0775  primosomal replication protein N  31.18 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000117168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002333  primosomal replication protein N  29.29 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.143952  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0795  primosomal replication protein N  31.52 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00210867  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4788  primosomal replication protein N  32.61 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0989089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4670  primosomal replication protein N  32.61 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0146499  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4660  primosomal replication protein N  32.61 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.514563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4810  primosomal replication protein N  32.61 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0747628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4752  primosomal replication protein N  32.61 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.289181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3434  primosomal replication protein N  30.11 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0112782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3792  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  32.61 
 
 		 104 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00701576  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3585  primosomal replication protein N  32.94 
 
 		 101 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0804517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>