44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3350 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3350  primosomal replication protein N  100 
 
 		 95 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000006513  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0516  primosomal replication protein N  86.17 
 
 		 100 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.321631  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0754  primosomal replication protein N  75.79 
 
 		 101 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000514049  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3929  primosomal replication protein N  75.79 
 
 		 101 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0702  primosomal replication protein N  75.79 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00024455  hitchhiker  0.000386663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3259  primosomal replication protein N  75.79 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0688  primosomal replication protein N  75.79 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000362584  hitchhiker  0.000302013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0712  primosomal replication protein N  75.79 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0733  primosomal replication protein N  75.79 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110902  hitchhiker  0.0000000106938 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3642  primosomal replication protein N  75.79 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00121069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0742  primosomal replication protein N  75.79 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000754533  hitchhiker  0.000130269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3585  primosomal replication protein N  73.68 
 
 		 101 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0804517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4211  primosomal replication protein N  72.63 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.493289  hitchhiker  0.000256968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0758  primosomal replication protein N  69.47 
 
 		 101 aa  141  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208555  hitchhiker  0.00000145919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3063  primosomal replication protein N  56.84 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451592  normal  0.213794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3283  single-strand binding protein/primosomal replication protein N  70.42 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0141389  hitchhiker  0.000204864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3638  primosomal replication protein N  43.62 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0795  primosomal replication protein N  42.55 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3591  primosomal replication protein N  41.49 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3434  primosomal replication protein N  41.49 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0112782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0775  primosomal replication protein N  41.94 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000117168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0447  primosomal replication protein N  40.86 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00438662 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0573  primosomal replication protein N  41.49 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.380411  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04030  hypothetical protein  37.23 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2765  primosomal replication protein N  43.01 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.941899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4788  primosomal replication protein N  37.63 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0989089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4670  primosomal replication protein N  37.63 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0146499  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4660  primosomal replication protein N  37.63 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.514563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4810  primosomal replication protein N  37.63 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0747628  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3792  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  37.23 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00701576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4752  primosomal replication protein N  37.63 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.289181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4734  primosomal replication protein N  37.23 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.207424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3812  primosomal replication protein N  37.23 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0549783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4762  primosomal replication protein N  37.23 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4445  primosomal replication protein N  37.23 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3420  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  39.13 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04068  primosomal replication protein N  37.23 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0372  primosomal replication protein N  37.23 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0387347  normal  0.0311517 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002333  primosomal replication protein N  42.86 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.143952  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00022  primosomal replication protein N  42.86 
 
 		 96 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2778  primosomal replication protein N  39.13 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000941139  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1437  primosomal replication protein N  36.9 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000292686  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0416  primosomal replication protein N  36.17 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3783  primosomal replication protein N  47.92 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>