More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2133 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2133  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 143 aa  295  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.226778  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2052  30S ribosomal protein S6  98.6 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00746  30S ribosomal protein S6  69.93 
 
 		 143 aa  200  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2589  30S ribosomal protein S6  75.44 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1935  ribosomal protein S6  63.36 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0753505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  58.59 
 
 		 134 aa  151  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  55.22 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  53.96 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  55.22 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4671  30S ribosomal protein S6  55.22 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  55.22 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  55.22 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  53.96 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4733  30S ribosomal protein S6  55.22 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.387811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4444  30S ribosomal protein S6  55.22 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  55.22 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5716  30S ribosomal protein S6  55.22 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.394601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  55.22 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  55.22 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4761  30S ribosomal protein S6  55.22 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  57.03 
 
 		 156 aa  150  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  65.69 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  58.26 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  63.3 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  63.55 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  65.38 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  54.14 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  61.9 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2830  30S ribosomal protein S6  57.72 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  64.42 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  60.75 
 
 		 138 aa  144  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  64.42 
 
 		 120 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  51.08 
 
 		 131 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  59.26 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  51.8 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  53.97 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  53.97 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  51.8 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  53.97 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  63.46 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  54.69 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 		 125 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 		 125 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  56.64 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  51.8 
 
 		 131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  58.93 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  59.63 
 
 		 128 aa  143  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  65.05 
 
 		 127 aa  143  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  62.83 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0657  30S ribosomal protein S6  54.87 
 
 		 119 aa  143  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  52.99 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  56.76 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3037  30S ribosomal protein S6  62.5 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00243043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  64.08 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  63.46 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  59.63 
 
 		 125 aa  141  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  58.49 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  64.08 
 
 		 124 aa  140  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  51.08 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  51.08 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2395  30S ribosomal protein S6  61.54 
 
 		 121 aa  140  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  52.76 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  61.54 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0927  30S ribosomal protein S6  57.39 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0134622  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  51.08 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1032  30S ribosomal protein S6  56.41 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  140  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3419  ribosomal protein S6  52.1 
 
 		 133 aa  140  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797124  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1087  30S ribosomal protein S6  62.14 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000589418  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0574  ribosomal protein S6  58.88 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  58.33 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1337  30S ribosomal protein S6  59.26 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.021992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  54.95 
 
 		 139 aa  137  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  47.83 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  54.76 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  57.41 
 
 		 125 aa  138  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  52.5 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0415  30S ribosomal protein S6  51.15 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  54.17 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0515  30S ribosomal protein S6  54.17 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.38245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  54.05 
 
 		 139 aa  137  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>