17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1146 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0407  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1146  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1166  hypothetical protein  95.56 
 
 
180 aa  334  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0365  hypothetical protein  95.56 
 
 
180 aa  334  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1295  hypothetical protein  38.73 
 
 
178 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0894  hypothetical protein  37.43 
 
 
184 aa  101  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.116948  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3404  hypothetical protein  34.32 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1203  hypothetical protein  31.36 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08000  hypothetical protein  30.95 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019047  hitchhiker  0.000226613 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1869  hypothetical protein  32.74 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3050  hypothetical protein  32.16 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002978  WD0643  hypothetical protein  28.67 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0759  hypothetical protein  28.57 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0279  hypothetical protein  26.53 
 
 
157 aa  61.2  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4047  phage protein  28.74 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000148405  hitchhiker  0.00000000000068714 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0686  hypothetical protein  25.32 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1634  hypothetical protein  24.73 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>