15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3404 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3404  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  353  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1203  hypothetical protein  63.64 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3050  hypothetical protein  60.8 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0759  hypothetical protein  43.43 
 
 		 171 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08000  hypothetical protein  42.94 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019047  hitchhiker  0.000226613 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1869  hypothetical protein  35.47 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0643  hypothetical protein  36.5 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1295  hypothetical protein  34.34 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4047  phage protein  32.74 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000148405  hitchhiker  0.00000000000068714 
 
 
-
 
NC_002978  WD0279  hypothetical protein  35.82 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0407  hypothetical protein  34.32 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1146  hypothetical protein  34.32 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0365  hypothetical protein  32.54 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1166  hypothetical protein  32.54 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0894  hypothetical protein  26.87 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.116948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>