15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0759 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0759  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  327  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08000  hypothetical protein  81.18 
 
 
171 aa  275  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019047  hitchhiker  0.000226613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3404  hypothetical protein  42.29 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3050  hypothetical protein  42.77 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1203  hypothetical protein  42.61 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1869  hypothetical protein  38.37 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4047  phage protein  34.12 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000148405  hitchhiker  0.00000000000068714 
 
 
-
 
NC_002978  WD0643  hypothetical protein  27.89 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0279  hypothetical protein  32.65 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1295  hypothetical protein  28.82 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0407  hypothetical protein  27.49 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1146  hypothetical protein  27.49 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0365  hypothetical protein  26.9 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1166  hypothetical protein  26.9 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2219  hypothetical protein  24.68 
 
 
178 aa  41.2  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00980381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>