17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1295 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1295  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0407  hypothetical protein  38.73 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1146  hypothetical protein  38.73 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1166  hypothetical protein  38.6 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0365  hypothetical protein  38.6 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1869  hypothetical protein  37.21 
 
 		 174 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0643  hypothetical protein  30.92 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0279  hypothetical protein  31.54 
 
 		 157 aa  87.8  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3404  hypothetical protein  34.34 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1203  hypothetical protein  36.75 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3050  hypothetical protein  32.74 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08000  hypothetical protein  27.98 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019047  hitchhiker  0.000226613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0759  hypothetical protein  28.82 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1634  hypothetical protein  27.59 
 
 		 183 aa  51.2  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0894  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.116948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4047  phage protein  25.15 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000148405  hitchhiker  0.00000000000068714 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0686  hypothetical protein  27.21 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>