17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1166 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1166  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  369  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0365  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  369  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0407  hypothetical protein  95.56 
 
 
180 aa  335  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1146  hypothetical protein  95.56 
 
 
180 aa  335  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1295  hypothetical protein  38.6 
 
 
178 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0894  hypothetical protein  38.55 
 
 
184 aa  103  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.116948  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3404  hypothetical protein  32.54 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08000  hypothetical protein  30.36 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019047  hitchhiker  0.000226613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1203  hypothetical protein  30.18 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1869  hypothetical protein  31.98 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0643  hypothetical protein  27.89 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3050  hypothetical protein  31.18 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0759  hypothetical protein  27.98 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0279  hypothetical protein  26.39 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4047  phage protein  28.32 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000148405  hitchhiker  0.00000000000068714 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0686  hypothetical protein  25.64 
 
 
164 aa  47.8  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1634  hypothetical protein  25.27 
 
 
183 aa  44.7  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>