16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1203 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1203  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3050  hypothetical protein  78.29 
 
 		 176 aa  280  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3404  hypothetical protein  63.64 
 
 		 175 aa  200  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08000  hypothetical protein  42.37 
 
 		 171 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019047  hitchhiker  0.000226613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0759  hypothetical protein  42.61 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1295  hypothetical protein  36.75 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_002978  WD0643  hypothetical protein  32.61 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4047  phage protein  32.94 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000148405  hitchhiker  0.00000000000068714 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1869  hypothetical protein  31.76 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0279  hypothetical protein  31.85 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0407  hypothetical protein  31.36 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1146  hypothetical protein  31.36 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0365  hypothetical protein  30.18 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1166  hypothetical protein  30.18 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0894  hypothetical protein  27.93 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.116948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1634  hypothetical protein  29.8 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>