16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3050 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3050  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  352  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1203  hypothetical protein  78.29 
 
 		 176 aa  280  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3404  hypothetical protein  60.8 
 
 		 175 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08000  hypothetical protein  41.48 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019047  hitchhiker  0.000226613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0759  hypothetical protein  42.77 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0279  hypothetical protein  32.59 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1869  hypothetical protein  32.93 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4047  phage protein  31.33 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000148405  hitchhiker  0.00000000000068714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1295  hypothetical protein  32.74 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0407  hypothetical protein  30.18 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1146  hypothetical protein  30.18 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0365  hypothetical protein  28.99 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1166  hypothetical protein  28.99 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0894  hypothetical protein  26.57 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.116948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1634  hypothetical protein  30.26 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>