15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1869 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1869  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0643  hypothetical protein  41.79 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0279  hypothetical protein  38.52 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08000  hypothetical protein  37.72 
 
 		 171 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019047  hitchhiker  0.000226613 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1295  hypothetical protein  37.21 
 
 		 178 aa  95.1  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3404  hypothetical protein  35.47 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0759  hypothetical protein  38.37 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3050  hypothetical protein  32.93 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1203  hypothetical protein  31.76 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632413 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0407  hypothetical protein  32.56 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1146  hypothetical protein  32.56 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0365  hypothetical protein  31.98 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1166  hypothetical protein  31.98 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4047  phage protein  24 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000148405  hitchhiker  0.00000000000068714 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0686  hypothetical protein  22.92 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>