More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0128 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0113  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  98.12 
 
 
847 aa  933    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0128  phosphomannomutase  100 
 
 
495 aa  1001    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  63.18 
 
 
782 aa  589  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  59.16 
 
 
782 aa  537  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  50.32 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  48.71 
 
 
463 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  47.84 
 
 
469 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  48.51 
 
 
468 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0414  phosphomannomutase  48.65 
 
 
489 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0893  phosphomannomutase  48.65 
 
 
489 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498123  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0920  Phosphomannomutase  46.51 
 
 
464 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  46.96 
 
 
464 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  46.77 
 
 
881 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0863  phosphomannomutase  49.26 
 
 
464 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  46.75 
 
 
458 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1489  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.99 
 
 
464 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0374748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0772  phosphomannomutase  48.53 
 
 
487 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  46.96 
 
 
488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2191  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.48 
 
 
472 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738295  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0783  phosphomannomutase  48.52 
 
 
464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3119  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.48 
 
 
472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3701  phosphomannomutase  46.84 
 
 
464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3083  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.48 
 
 
472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  47.71 
 
 
863 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.47 
 
 
464 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.020226  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  45.43 
 
 
465 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3143  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.26 
 
 
464 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2550  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.47 
 
 
464 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  46.68 
 
 
854 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.48 
 
 
961 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  46.46 
 
 
868 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  43.41 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  44.4 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  45.65 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  43.41 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3990  phosphomannomutase  47.26 
 
 
464 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.047705 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  46.07 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  44.35 
 
 
465 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  45 
 
 
463 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  45.22 
 
 
466 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  45.77 
 
 
457 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  48.41 
 
 
467 aa  395  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  45 
 
 
466 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  45.42 
 
 
461 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  46.74 
 
 
465 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  45 
 
 
465 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  44.35 
 
 
461 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  44.02 
 
 
461 aa  388  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  44.56 
 
 
461 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  43.16 
 
 
461 aa  388  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  45.34 
 
 
464 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  44.14 
 
 
462 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  44.14 
 
 
462 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  43.45 
 
 
462 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  43.45 
 
 
462 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2443  phosphomannomutase  43.13 
 
 
472 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.299376 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  42.58 
 
 
461 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  41.99 
 
 
460 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  44.37 
 
 
463 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  42.14 
 
 
461 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  42.61 
 
 
486 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  42.7 
 
 
462 aa  362  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  41.67 
 
 
475 aa  360  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  42.95 
 
 
460 aa  359  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  43.11 
 
 
460 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  40.49 
 
 
462 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  40.93 
 
 
462 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  39 
 
 
830 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  39.14 
 
 
472 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  37.67 
 
 
458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  39.83 
 
 
469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  40.71 
 
 
469 aa  311  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  36.82 
 
 
456 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  38.9 
 
 
457 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  36.88 
 
 
456 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  37.45 
 
 
456 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  36.88 
 
 
456 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  37.5 
 
 
449 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  35.44 
 
 
447 aa  296  6e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  37.92 
 
 
464 aa  296  8e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  37.23 
 
 
466 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  37.56 
 
 
453 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  35.53 
 
 
450 aa  294  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  33.48 
 
 
475 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  35.54 
 
 
462 aa  290  3e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  37.21 
 
 
453 aa  290  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  38.46 
 
 
460 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  34.68 
 
 
455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  35.75 
 
 
469 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  34.85 
 
 
469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  37.33 
 
 
467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  34.56 
 
 
474 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  36.5 
 
 
460 aa  262  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3316  phosphomannomutase  35.34 
 
 
467 aa  260  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  33.69 
 
 
468 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5049  Phosphomannomutase  35.04 
 
 
479 aa  251  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.477893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  34.48 
 
 
459 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1406  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  32.89 
 
 
456 aa  232  9e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0418  phosphomannomutase/phosphoglucomutase (PMM/PGM)  31.3 
 
 
460 aa  230  4e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1594  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  32.59 
 
 
456 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>