More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0920 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0783  phosphomannomutase  84.27 
 
 
464 aa  786    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  65.23 
 
 
461 aa  638    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  91.59 
 
 
464 aa  878    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  68.25 
 
 
461 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2191  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  84.91 
 
 
472 aa  790    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738295  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  69.76 
 
 
461 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0863  phosphomannomutase  84.91 
 
 
464 aa  790    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3143  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  84.7 
 
 
464 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  84.48 
 
 
485 aa  816    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3990  phosphomannomutase  83.41 
 
 
464 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.047705 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1489  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  85.34 
 
 
464 aa  793    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0374748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3701  phosphomannomutase  97.2 
 
 
464 aa  925    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3119  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  84.91 
 
 
472 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  84.91 
 
 
464 aa  791    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.020226  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  70.19 
 
 
461 aa  675    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0414  phosphomannomutase  84.48 
 
 
489 aa  789    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0772  phosphomannomutase  84.27 
 
 
487 aa  788    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2550  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  84.91 
 
 
464 aa  791    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0893  phosphomannomutase  84.48 
 
 
489 aa  789    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3083  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  84.91 
 
 
472 aa  791    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835798  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  68.47 
 
 
462 aa  679    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  68.03 
 
 
462 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0920  Phosphomannomutase  100 
 
 
464 aa  945    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  84.91 
 
 
961 aa  793    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  65.66 
 
 
461 aa  632  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  64.79 
 
 
458 aa  614  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  63.99 
 
 
457 aa  610  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  62.69 
 
 
457 aa  605  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  62.66 
 
 
469 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  60.6 
 
 
465 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  60.52 
 
 
463 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  57.54 
 
 
462 aa  543  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  56.74 
 
 
460 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  57.54 
 
 
462 aa  545  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  56.37 
 
 
460 aa  538  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  58.71 
 
 
486 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  56.03 
 
 
468 aa  535  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  56.59 
 
 
461 aa  537  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  56.25 
 
 
462 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  54.88 
 
 
463 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2443  phosphomannomutase  54.49 
 
 
472 aa  519  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.299376 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  54.78 
 
 
782 aa  521  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  54.53 
 
 
854 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  55.36 
 
 
488 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  54.53 
 
 
868 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  54.66 
 
 
466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  53.88 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  54.45 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  55 
 
 
863 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  54.66 
 
 
466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  54.6 
 
 
475 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  56.6 
 
 
467 aa  511  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  53.75 
 
 
465 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  54.45 
 
 
465 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  53.85 
 
 
469 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  54.29 
 
 
463 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  55.39 
 
 
460 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  52.83 
 
 
881 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  50.32 
 
 
461 aa  491  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  51.93 
 
 
471 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  51.93 
 
 
471 aa  494  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  52.79 
 
 
464 aa  489  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  52.23 
 
 
782 aa  482  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  46.55 
 
 
462 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  46.34 
 
 
462 aa  438  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  47.35 
 
 
830 aa  425  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  46.78 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  46.56 
 
 
456 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  46.12 
 
 
456 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0113  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  46.72 
 
 
847 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0128  phosphomannomutase  46.51 
 
 
495 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  43.24 
 
 
456 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  45.96 
 
 
458 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  44.37 
 
 
449 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  42.44 
 
 
447 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  45.29 
 
 
472 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  42.6 
 
 
457 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  44.15 
 
 
469 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  43.64 
 
 
453 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  42.32 
 
 
464 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  40.42 
 
 
475 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  45.17 
 
 
469 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  44.57 
 
 
460 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  44.22 
 
 
460 aa  363  4e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  42.86 
 
 
466 aa  362  6e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  39.69 
 
 
450 aa  355  7.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  43.36 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  41.85 
 
 
469 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3316  phosphomannomutase  41.16 
 
 
467 aa  350  3e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  39.58 
 
 
474 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  41.65 
 
 
453 aa  347  3e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  44.22 
 
 
468 aa  343  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  39.21 
 
 
462 aa  342  9e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  38.99 
 
 
455 aa  339  7e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  42.22 
 
 
467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  41.21 
 
 
459 aa  331  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5049  Phosphomannomutase  39.79 
 
 
479 aa  321  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.477893 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0256  phosphohexosemutase  37.61 
 
 
455 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.769457  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0306  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.71 
 
 
455 aa  300  4e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0317157  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0623  phosphomannomutase  36.44 
 
 
452 aa  300  5e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>