21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3695 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Replicon accession

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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3695  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 
135 aa  274  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5721  endodeoxyribonuclease RusA  50.35 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1739  endodeoxyribonuclease RusA  41.79 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000109309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3008  endodeoxyribonuclease RusA  44.27 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2398  endodeoxyribonuclease RusA  42.97 
 
 
149 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7130  endodeoxyribonuclease RusA  40.91 
 
 
180 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0963838  hitchhiker  0.0000462878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2384  endodeoxyribonuclease RusA  38.97 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0419395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1833  endodeoxyribonuclease RusA  41.91 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0662  endodeoxyribonuclease RusA  38.26 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0942  endodeoxyribonuclease RusA family protein  36.13 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0591  Holliday junction resolvase  32.61 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0193428  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0653  Holliday junction resolvase  32.61 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000136135  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2445  endodeoxyribonuclease RusA  34.71 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2036  endodeoxyribonuclease RusA  31.45 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2073  endodeoxyribonuclease RusA  31.45 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.406087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0334  endodeoxyribonuclease RusA  31.45 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0325  endodeoxyribonuclease RusA  31.45 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0790  endodeoxyribonuclease RusA  31.03 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.972343  normal  0.0109433 
 
 
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NC_009436  Ent638_2254  endodeoxyribonuclease RusA  40.91 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.151329  hitchhiker  0.00132872 
 
 
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NC_007964  Nham_0308  endodeoxyribonuclease RusA  26.81 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_2598  endodeoxyribonuclease RusA  36 
 
 
141 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000397063  decreased coverage  0.000000107809 
 
 
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