22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1739 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1739  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 		 146 aa  294  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000109309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2398  endodeoxyribonuclease RusA  63.19 
 
 		 149 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2384  endodeoxyribonuclease RusA  51.77 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0419395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3008  endodeoxyribonuclease RusA  48.89 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1833  endodeoxyribonuclease RusA  49.26 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3695  endodeoxyribonuclease RusA  41.79 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7130  endodeoxyribonuclease RusA  41.09 
 
 		 180 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0963838  hitchhiker  0.0000462878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5721  endodeoxyribonuclease RusA  45 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0591  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 		 153 aa  95.9  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0193428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0653  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 		 153 aa  95.9  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000136135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0942  endodeoxyribonuclease RusA family protein  42.62 
 
 		 128 aa  84.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0662  endodeoxyribonuclease RusA  36.03 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0504  endodeoxyribonuclease RusA  33.33 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000274562  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0334  endodeoxyribonuclease RusA  32 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2073  endodeoxyribonuclease RusA  32 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.406087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2036  endodeoxyribonuclease RusA  32 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0325  endodeoxyribonuclease RusA  32 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0569  hypothetical protein  26.58 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2445  endodeoxyribonuclease RusA  33.33 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2598  endodeoxyribonuclease RusA  35.94 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000397063  decreased coverage  0.000000107809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2254  endodeoxyribonuclease RusA  27.19 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.151329  hitchhiker  0.00132872 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3302  endodeoxyribonuclease RusA  40 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>