22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2445 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2445  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0504  endodeoxyribonuclease RusA  40 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000274562  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3008  endodeoxyribonuclease RusA  31.93 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1833  endodeoxyribonuclease RusA  33.58 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0942  endodeoxyribonuclease RusA family protein  33.61 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2384  endodeoxyribonuclease RusA  31.93 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0419395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1739  endodeoxyribonuclease RusA  33.33 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000109309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3695  endodeoxyribonuclease RusA  34.71 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2398  endodeoxyribonuclease RusA  30.77 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2598  endodeoxyribonuclease RusA  37.08 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000397063  decreased coverage  0.000000107809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0308  endodeoxyribonuclease RusA  37.97 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0662  endodeoxyribonuclease RusA  34.62 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7130  endodeoxyribonuclease RusA  30.91 
 
 
180 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0963838  hitchhiker  0.0000462878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3153  endodeoxyribonuclease RusA  39.29 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00500  endonuclease RUS  30 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.377255  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54080  endodeoxyribonuclease  48.72 
 
 
386 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00505  hypothetical protein  29.63 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.320878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3364  endodeoxyribonuclease RusA  46.67 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0618192  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2045  endodeoxyribonuclease RusA  40.91 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.840404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3222  endodeoxyribonuclease RUS  29.81 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298592  hitchhiker  0.00412793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1609  endodeoxyribonuclease RUS  28.18 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0821  endodeoxyribonuclease RUS  27.27 
 
 
120 aa  40  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>