23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7130 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7130  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0963838  hitchhiker  0.0000462878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2384  endodeoxyribonuclease RusA  41.61 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0419395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2398  endodeoxyribonuclease RusA  43.94 
 
 		 149 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1739  endodeoxyribonuclease RusA  41.09 
 
 		 146 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000109309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3695  endodeoxyribonuclease RusA  40.91 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0591  Holliday junction resolvase  38.73 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0193428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0653  Holliday junction resolvase  38.73 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000136135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1833  endodeoxyribonuclease RusA  41.61 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3008  endodeoxyribonuclease RusA  39.52 
 
 		 135 aa  91.7  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0942  endodeoxyribonuclease RusA family protein  37.61 
 
 		 128 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0662  endodeoxyribonuclease RusA  33.57 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5721  endodeoxyribonuclease RusA  32.59 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0569  hypothetical protein  24.05 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0334  endodeoxyribonuclease RusA  31.06 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2073  endodeoxyribonuclease RusA  31.06 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.406087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2036  endodeoxyribonuclease RusA  31.06 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0325  endodeoxyribonuclease RusA  31.06 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0504  endodeoxyribonuclease RusA  34.62 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000274562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2445  endodeoxyribonuclease RusA  30.91 
 
 		 124 aa  48.5  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2045  endodeoxyribonuclease RusA  48.78 
 
 		 112 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.840404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3364  endodeoxyribonuclease RusA  41.46 
 
 		 132 aa  44.3  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0618192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54080  endodeoxyribonuclease  27.59 
 
 		 386 aa  41.2  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2598  endodeoxyribonuclease RusA  39.58 
 
 		 141 aa  41.2  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000397063  decreased coverage  0.000000107809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>