22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0942 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0942  endodeoxyribonuclease RusA family protein  100 
 
 		 128 aa  256  8e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2398  endodeoxyribonuclease RusA  40.77 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1739  endodeoxyribonuclease RusA  42.62 
 
 		 146 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000109309 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0591  Holliday junction resolvase  39.26 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0193428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0653  Holliday junction resolvase  39.26 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000136135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2384  endodeoxyribonuclease RusA  36.67 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0419395  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7130  endodeoxyribonuclease RusA  37.61 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0963838  hitchhiker  0.0000462878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1833  endodeoxyribonuclease RusA  37.19 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3008  endodeoxyribonuclease RusA  36.13 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3695  endodeoxyribonuclease RusA  36.13 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0662  endodeoxyribonuclease RusA  41.38 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2598  endodeoxyribonuclease RusA  36.36 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000397063  decreased coverage  0.000000107809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5721  endodeoxyribonuclease RusA  36.57 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2445  endodeoxyribonuclease RusA  33.61 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0569  hypothetical protein  29.7 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0504  endodeoxyribonuclease RusA  29.09 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000274562  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54080  endodeoxyribonuclease  38.46 
 
 		 386 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2073  endodeoxyribonuclease RusA  48.57 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.406087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0334  endodeoxyribonuclease RusA  48.57 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2036  endodeoxyribonuclease RusA  48.57 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0325  endodeoxyribonuclease RusA  48.57 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0790  endodeoxyribonuclease RusA  30.77 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.972343  normal  0.0109433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>