28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3008 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3008  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2384  endodeoxyribonuclease RusA  48.92 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0419395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1739  endodeoxyribonuclease RusA  48.89 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000109309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2398  endodeoxyribonuclease RusA  49.25 
 
 		 149 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1833  endodeoxyribonuclease RusA  46.51 
 
 		 156 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3695  endodeoxyribonuclease RusA  44.27 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0662  endodeoxyribonuclease RusA  43.94 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5721  endodeoxyribonuclease RusA  40.58 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7130  endodeoxyribonuclease RusA  39.52 
 
 		 180 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0963838  hitchhiker  0.0000462878 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0591  Holliday junction resolvase  32.67 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0193428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0653  Holliday junction resolvase  32.67 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000136135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0942  endodeoxyribonuclease RusA family protein  36.13 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0504  endodeoxyribonuclease RusA  34.62 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000274562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2445  endodeoxyribonuclease RusA  31.93 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0325  endodeoxyribonuclease RusA  34.07 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2036  endodeoxyribonuclease RusA  34.07 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0334  endodeoxyribonuclease RusA  34.07 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2073  endodeoxyribonuclease RusA  34.07 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.406087  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0790  endodeoxyribonuclease RusA  36.36 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.972343  normal  0.0109433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3302  endodeoxyribonuclease RusA  30.16 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1112  Holliday junction resolvase  26.15 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.342331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2254  endodeoxyribonuclease RusA  29.36 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.151329  hitchhiker  0.00132872 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0569  hypothetical protein  34.38 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1793  Holliday junction resolvase  25.38 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2598  endodeoxyribonuclease RusA  34.07 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000397063  decreased coverage  0.000000107809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0308  endodeoxyribonuclease RusA  30.09 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2045  endodeoxyribonuclease RusA  48.78 
 
 		 112 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.840404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0415  hypothetical protein  65.38 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0960401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>