23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0334 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2073  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 		 134 aa  279  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.406087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0334  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 		 134 aa  279  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2036  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 		 134 aa  279  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0325  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 		 134 aa  279  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2384  endodeoxyribonuclease RusA  34.38 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0419395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2398  endodeoxyribonuclease RusA  32.8 
 
 		 149 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3008  endodeoxyribonuclease RusA  34.07 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1739  endodeoxyribonuclease RusA  32 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000109309 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7130  endodeoxyribonuclease RusA  31.06 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0963838  hitchhiker  0.0000462878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3695  endodeoxyribonuclease RusA  33.06 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1833  endodeoxyribonuclease RusA  30.77 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0662  endodeoxyribonuclease RusA  28.7 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0569  hypothetical protein  28.47 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2254  endodeoxyribonuclease RusA  31.5 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.151329  hitchhiker  0.00132872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0790  endodeoxyribonuclease RusA  36.76 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.972343  normal  0.0109433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5721  endodeoxyribonuclease RusA  33.75 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0653  Holliday junction resolvase  25.35 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000136135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0942  endodeoxyribonuclease RusA family protein  40.85 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0591  Holliday junction resolvase  25.35 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0193428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0308  endodeoxyribonuclease RusA  36.25 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54080  endodeoxyribonuclease  47.06 
 
 		 386 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2598  endodeoxyribonuclease RusA  33.87 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000397063  decreased coverage  0.000000107809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3302  endodeoxyribonuclease RusA  40 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>