20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2398 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2398  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 		 149 aa  303  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1739  endodeoxyribonuclease RusA  63.19 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000109309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2384  endodeoxyribonuclease RusA  50 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0419395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1833  endodeoxyribonuclease RusA  48.05 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3008  endodeoxyribonuclease RusA  49.25 
 
 		 135 aa  123  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7130  endodeoxyribonuclease RusA  43.94 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0963838  hitchhiker  0.0000462878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3695  endodeoxyribonuclease RusA  42.97 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0591  Holliday junction resolvase  37.33 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0193428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0653  Holliday junction resolvase  37.33 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000136135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5721  endodeoxyribonuclease RusA  39.16 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0942  endodeoxyribonuclease RusA family protein  40.77 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0662  endodeoxyribonuclease RusA  38.69 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0504  endodeoxyribonuclease RusA  32.56 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000274562  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0334  endodeoxyribonuclease RusA  30.4 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2073  endodeoxyribonuclease RusA  30.4 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.406087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2036  endodeoxyribonuclease RusA  30.4 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0325  endodeoxyribonuclease RusA  30.4 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2445  endodeoxyribonuclease RusA  30.77 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2598  endodeoxyribonuclease RusA  33.33 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000397063  decreased coverage  0.000000107809 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0569  hypothetical protein  23.03 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>