24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0662 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0662  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 		 144 aa  290  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3008  endodeoxyribonuclease RusA  43.94 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2384  endodeoxyribonuclease RusA  36.03 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0419395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1739  endodeoxyribonuclease RusA  36.03 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000109309 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7130  endodeoxyribonuclease RusA  33.57 
 
 		 180 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0963838  hitchhiker  0.0000462878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3695  endodeoxyribonuclease RusA  38.26 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2398  endodeoxyribonuclease RusA  38.69 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0942  endodeoxyribonuclease RusA family protein  41.38 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1833  endodeoxyribonuclease RusA  38.71 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2598  endodeoxyribonuclease RusA  43.14 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000397063  decreased coverage  0.000000107809 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0653  Holliday junction resolvase  31.76 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000136135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0591  Holliday junction resolvase  31.76 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0193428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0504  endodeoxyribonuclease RusA  32.82 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000274562  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5721  endodeoxyribonuclease RusA  31.88 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2445  endodeoxyribonuclease RusA  34.62 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0790  endodeoxyribonuclease RusA  42.86 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.972343  normal  0.0109433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2254  endodeoxyribonuclease RusA  37.14 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.151329  hitchhiker  0.00132872 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2036  endodeoxyribonuclease RusA  28.7 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0334  endodeoxyribonuclease RusA  28.7 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2073  endodeoxyribonuclease RusA  28.7 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.406087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0325  endodeoxyribonuclease RusA  28.7 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3364  endodeoxyribonuclease RusA  34.52 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0618192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2281  holiday-junction resolvase  30.17 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.328249  hitchhiker  1.35608e-22 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3302  endodeoxyribonuclease RusA  31.4 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>