26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0308 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0308  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 		 112 aa  229  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2598  endodeoxyribonuclease RusA  39.71 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000397063  decreased coverage  0.000000107809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0504  endodeoxyribonuclease RusA  48.98 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000274562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2445  endodeoxyribonuclease RusA  37.97 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2045  endodeoxyribonuclease RusA  35.96 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.840404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3008  endodeoxyribonuclease RusA  30.09 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3222  endodeoxyribonuclease RUS  28.04 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298592  hitchhiker  0.00412793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1260  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  32.98 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000987444  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54080  endodeoxyribonuclease  45 
 
 		 386 aa  42.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3695  endodeoxyribonuclease RusA  26.81 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2281  holiday-junction resolvase  26.32 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.328249  hitchhiker  1.35608e-22 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0495  endodeoxyribonuclease RusA  31.3 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0344152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00500  endonuclease RUS  27.36 
 
 		 120 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.377255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1609  endodeoxyribonuclease RUS  27.1 
 
 		 120 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000257059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0821  endodeoxyribonuclease RUS  27.1 
 
 		 120 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1845  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  33.71 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000255271  hitchhiker  0.00000000107565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3154  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  33.71 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000295998  hitchhiker  0.0000000000179448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1441  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  31.18 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2073  endodeoxyribonuclease RusA  45.45 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.406087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0334  endodeoxyribonuclease RusA  45.45 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2036  endodeoxyribonuclease RusA  45.45 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00505  hypothetical protein  27.62 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.320878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0325  endodeoxyribonuclease RusA  45.45 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0415  hypothetical protein  42.22 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0960401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2799  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA homolog  31.18 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.629369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3364  endodeoxyribonuclease RusA  37.5 
 
 		 132 aa  40  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0618192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>