25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2799 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2799  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA homolog  100 
 
 
119 aa  240  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.629369  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2267  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA homolog  93.28 
 
 
119 aa  226  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565025  hitchhiker  0.0000000001404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1267  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  94.02 
 
 
121 aa  223  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00142112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1435  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  92.44 
 
 
119 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00173864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1175  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  91.45 
 
 
121 aa  219  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000177122  hitchhiker  0.000000000000201219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1764  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  91.53 
 
 
119 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387819  hitchhiker  0.00606421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3154  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  94.69 
 
 
124 aa  215  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000295998  hitchhiker  0.0000000000179448 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1845  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  94.69 
 
 
124 aa  215  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000255271  hitchhiker  0.00000000107565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1159  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  90.52 
 
 
123 aa  211  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.52129 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1260  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  90.27 
 
 
124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000987444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1441  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  93.69 
 
 
126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0300  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  63.48 
 
 
120 aa  155  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1523  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  94.87 
 
 
85 aa  148  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2281  holiday-junction resolvase  41.94 
 
 
129 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.328249  hitchhiker  1.35608e-22 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00500  endonuclease RUS  40.18 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.377255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3222  endodeoxyribonuclease RUS  41.07 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298592  hitchhiker  0.00412793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4449  bacteriophage V crossover junction endodeoxyribonuclease  40.98 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00181578  unclonable  0.00000000115544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2155  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  40.98 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00505  hypothetical protein  39.64 
 
 
115 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.320878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1609  endodeoxyribonuclease RUS  39.29 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0821  endodeoxyribonuclease RUS  40.18 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11836  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3595  endodeoxyribonuclease RusA  36.78 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0872  endodeoxyribonuclease RusA  28.35 
 
 
150 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1129  endodeoxyribonuclease RusA  32.71 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00235578  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0308  endodeoxyribonuclease RusA  31.18 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>