13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0504 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0504  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 		 114 aa  236  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000274562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2445  endodeoxyribonuclease RusA  40 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1739  endodeoxyribonuclease RusA  33.33 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000109309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2398  endodeoxyribonuclease RusA  32.56 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3008  endodeoxyribonuclease RusA  34.62 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0662  endodeoxyribonuclease RusA  32.82 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2384  endodeoxyribonuclease RusA  30.66 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0419395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1833  endodeoxyribonuclease RusA  36.13 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0415  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0960401 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7130  endodeoxyribonuclease RusA  34.62 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0963838  hitchhiker  0.0000462878 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0308  endodeoxyribonuclease RusA  48.98 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2598  endodeoxyribonuclease RusA  36.67 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000397063  decreased coverage  0.000000107809 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0942  endodeoxyribonuclease RusA family protein  29.09 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>