18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5721 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5721  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 
152 aa  306  9e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3695  endodeoxyribonuclease RusA  50.35 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1739  endodeoxyribonuclease RusA  45 
 
 
146 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000109309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3008  endodeoxyribonuclease RusA  40.58 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2398  endodeoxyribonuclease RusA  39.16 
 
 
149 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2384  endodeoxyribonuclease RusA  35.92 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0419395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1833  endodeoxyribonuclease RusA  35.37 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7130  endodeoxyribonuclease RusA  32.59 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0963838  hitchhiker  0.0000462878 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0942  endodeoxyribonuclease RusA family protein  36.57 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0653  Holliday junction resolvase  30.5 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000136135  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0591  Holliday junction resolvase  30.5 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0193428  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0662  endodeoxyribonuclease RusA  31.88 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2254  endodeoxyribonuclease RusA  41.79 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.151329  hitchhiker  0.00132872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0790  endodeoxyribonuclease RusA  35.64 
 
 
119 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.972343  normal  0.0109433 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0325  endodeoxyribonuclease RusA  40.82 
 
 
134 aa  40.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2036  endodeoxyribonuclease RusA  40.82 
 
 
134 aa  40.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0334  endodeoxyribonuclease RusA  40.82 
 
 
134 aa  40.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2073  endodeoxyribonuclease RusA  40.82 
 
 
134 aa  40.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.406087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>