45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2747 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2747  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  356  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2076  hypothetical protein  41.57 
 
 
196 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1193  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  34.25 
 
 
196 aa  94.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5508  hypothetical protein  36.53 
 
 
170 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5867  molybdenum transport component, ATP-binding protein ModC  35.71 
 
 
185 aa  90.9  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1187  hypothetical protein  34.59 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.963781  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5195  hypothetical protein  38.66 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4317  hypothetical protein  31.48 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000958638  normal  0.0413497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5394  hypothetical protein  31.36 
 
 
191 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0852  hypothetical protein  36.48 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0294  hypothetical protein  32.54 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.881437  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0270  hypothetical protein  32.54 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2896  hypothetical protein  34 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.876495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0966  hypothetical protein  41.13 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5201  hypothetical protein  32.16 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2276  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108208  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1055  hypothetical protein  39.34 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0135  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  35.53 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0933  hypothetical protein  32.48 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0467352  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3410  hypothetical protein  33.72 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217104  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3002  hypothetical protein  30.52 
 
 
312 aa  67.8  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.935893  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1578  hypothetical protein  30.82 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2724  hypothetical protein  32.54 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180261  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2557  hypothetical protein  37.33 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4320  hypothetical protein  34.23 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0356129  normal  0.0779574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3672  hypothetical protein  32.41 
 
 
171 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3844  hypothetical protein  28.75 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1074  hypothetical protein  30.28 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.847783  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0979  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  29.33 
 
 
189 aa  61.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0204451 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0960  hypothetical protein  31.37 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1987  hypothetical protein  29.87 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2951  hypothetical protein  36.05 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.568018  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6153  hypothetical protein  35.37 
 
 
174 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4647  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  33.13 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2053  3-dehydroquinate dehydratase  28.74 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0869  hypothetical protein  31.74 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1092  hypothetical protein  30 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5674  hypothetical protein  30.11 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2477  hypothetical protein  30.71 
 
 
207 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.843664  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4231  hypothetical protein  33.91 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658834  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1988  hypothetical protein  26 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1479  hypothetical protein  27.78 
 
 
188 aa  48.5  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5082  3-dehydroquinate dehydratase  28.07 
 
 
195 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0989  hypothetical protein  27.53 
 
 
194 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0923234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3221  hypothetical protein  24.54 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>