45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0989 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0989  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0923234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1092  hypothetical protein  79.9 
 
 		 194 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5082  3-dehydroquinate dehydratase  66.67 
 
 		 195 aa  267  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4441  hypothetical protein  52.91 
 
 		 196 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2053  3-dehydroquinate dehydratase  31.06 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0979  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0204451 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4231  hypothetical protein  35.29 
 
 		 170 aa  85.5  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1987  hypothetical protein  33.56 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3002  hypothetical protein  34.59 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.935893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5201  hypothetical protein  30.3 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2276  hypothetical protein  28.75 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3672  hypothetical protein  40.4 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0294  hypothetical protein  31.29 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.881437  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0270  hypothetical protein  31.29 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2896  hypothetical protein  26.35 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.876495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5867  molybdenum transport component, ATP-binding protein ModC  30.07 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4647  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  31.4 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0960  hypothetical protein  28.05 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4317  hypothetical protein  27.67 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000958638  normal  0.0413497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1074  hypothetical protein  32.08 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.847783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2076  hypothetical protein  24.62 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2951  hypothetical protein  32.41 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.568018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0135  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  29.76 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6153  hypothetical protein  32.41 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4320  hypothetical protein  35.64 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0356129  normal  0.0779574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2557  hypothetical protein  31.88 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5674  hypothetical protein  33.54 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5394  hypothetical protein  29.24 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0852  hypothetical protein  25.73 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1187  hypothetical protein  26.09 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.963781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1578  hypothetical protein  31.97 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1193  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  25.45 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0869  hypothetical protein  31.21 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3844  hypothetical protein  30.61 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2724  hypothetical protein  32.76 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3410  hypothetical protein  29.7 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1055  hypothetical protein  25.79 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1479  hypothetical protein  30.97 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1988  hypothetical protein  26.67 
 
 		 177 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0933  hypothetical protein  25.79 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0467352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3221  hypothetical protein  25.66 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2477  hypothetical protein  25.17 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.843664  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5195  hypothetical protein  24.56 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2747  hypothetical protein  27.53 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0966  hypothetical protein  28.8 
 
 		 204 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>