46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0960 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0960  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0852  hypothetical protein  74.6 
 
 		 189 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5201  hypothetical protein  73.02 
 
 		 189 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4320  hypothetical protein  60.43 
 
 		 188 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0356129  normal  0.0779574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3410  hypothetical protein  55.08 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3844  hypothetical protein  58.51 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0933  hypothetical protein  52.94 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0467352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0979  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  36.81 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0204451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5867  molybdenum transport component, ATP-binding protein ModC  37.28 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1193  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3002  hypothetical protein  35.8 
 
 		 312 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.935893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4317  hypothetical protein  31.33 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000958638  normal  0.0413497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1055  hypothetical protein  35.62 
 
 		 209 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2724  hypothetical protein  39.16 
 
 		 171 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1187  hypothetical protein  32.5 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.963781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3672  hypothetical protein  32.92 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2276  hypothetical protein  32.73 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1479  hypothetical protein  29.07 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0135  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2053  3-dehydroquinate dehydratase  31.65 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2951  hypothetical protein  35.8 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.568018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6153  hypothetical protein  36.02 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1092  hypothetical protein  29.88 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1987  hypothetical protein  32.3 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5394  hypothetical protein  31.36 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1074  hypothetical protein  32.1 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.847783  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0989  hypothetical protein  28.05 
 
 		 194 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0923234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2477  hypothetical protein  31.93 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.843664  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2896  hypothetical protein  29.63 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.876495  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4231  hypothetical protein  34.59 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2557  hypothetical protein  36.29 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0270  hypothetical protein  30.12 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0294  hypothetical protein  30.12 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.881437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5674  hypothetical protein  33.73 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5082  3-dehydroquinate dehydratase  27.88 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3221  hypothetical protein  30.06 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4647  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  29.34 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5195  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1988  hypothetical protein  31.93 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4441  hypothetical protein  31.55 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2076  hypothetical protein  28.81 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5508  hypothetical protein  28.87 
 
 		 170 aa  62  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2747  hypothetical protein  31.37 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0869  hypothetical protein  36.67 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0966  hypothetical protein  32.5 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1578  hypothetical protein  29.17 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>